More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0041 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  593  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  78.36 
 
 		 305 aa  484  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  77.38 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  73.93 
 
 		 302 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  51.82 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  41.36 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  36.21 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  36.49 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  38.01 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  29.68 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  31.63 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  33.11 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  30.72 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  29.14 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  37.59 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  33.12 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.03 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  30.88 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  31.08 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  31.08 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  31.08 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  31.08 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  31.08 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  30.89 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  33.78 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  33.44 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  33.45 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  32.23 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  32.44 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.7 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  33.77 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  31.29 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  32.12 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.66 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.97 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  31.25 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  28.25 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  28.25 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  32.89 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  31.13 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  36.21 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  32.34 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  31.51 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.52 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  31.49 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  34.83 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  29.33 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  35.56 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  34.11 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  32.2 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  31.13 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  31.89 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  32.2 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.26 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  31.13 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  34 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  33.44 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  33.44 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.32 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  33.12 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  31.08 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  33 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  31.08 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  33.44 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  28.12 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.13 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  28.08 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  33.11 
 
 		 314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  33.11 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  33.11 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  33.11 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  30.48 
 
 		 317 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  33.22 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  33.11 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  28.99 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  37.4 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  26.05 
 
 		 404 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  30.72 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  31.7 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.94 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  32.78 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.13 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  25.96 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  32.78 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  33.12 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  34.2 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  37.01 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  31.31 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  29.53 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  30.4 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>