More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2001 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  100 
 
 
321 aa  639    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  66.02 
 
 
317 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  58.5 
 
 
320 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  48.68 
 
 
309 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  37.41 
 
 
303 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  35.59 
 
 
314 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  34.78 
 
 
298 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  36.33 
 
 
316 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  33.22 
 
 
297 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  35.22 
 
 
304 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  32.55 
 
 
297 aa  142  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  33.9 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.76 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 
305 aa  129  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  34.01 
 
 
304 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  36.33 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  31.43 
 
 
288 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  33.21 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  36.3 
 
 
287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  31.3 
 
 
320 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  31.16 
 
 
317 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  31.41 
 
 
424 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 
302 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 
328 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 
337 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  26.67 
 
 
333 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  34.14 
 
 
298 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  26.88 
 
 
333 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  30.94 
 
 
330 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.54 
 
 
323 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.39 
 
 
308 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 
398 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  33.19 
 
 
309 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  31.73 
 
 
311 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  34.19 
 
 
305 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 
308 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.37 
 
 
323 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  36.07 
 
 
308 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  30 
 
 
403 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  29.82 
 
 
335 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.94 
 
 
308 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  30.18 
 
 
335 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  35.8 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.26 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  27.22 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.2 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  31.36 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  28.31 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.97 
 
 
329 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.17 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  31.43 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.6 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  31.98 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.6 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  29.48 
 
 
337 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  29.48 
 
 
337 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  26.48 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  35.39 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.65 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  28.1 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.64 
 
 
313 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.64 
 
 
313 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.51 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.64 
 
 
313 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  31.46 
 
 
305 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.51 
 
 
313 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  24.57 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  31.94 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.99 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.33 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  32.21 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  31.44 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 
301 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.13 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.87 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  35.38 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  31.31 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  29.37 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.05 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  35.29 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  30.91 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.97 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.16 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.57 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  31.66 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.82 
 
 
311 aa  89  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  33.07 
 
 
311 aa  89  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  28.75 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.37 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.02 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.39 
 
 
308 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>