More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0252 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  100 
 
 
283 aa  569  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  51.29 
 
 
269 aa  277  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.53 
 
 
304 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
310 aa  106  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  28.2 
 
 
304 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.52 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.73 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 
305 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.69 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 
318 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.7 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 
308 aa  89  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  26.92 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.08 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  28 
 
 
307 aa  85.5  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.57 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.07 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.39 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  27.46 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.37 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  26.54 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  26.54 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  29.55 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.23 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  26 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  24.48 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  25 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.46 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  25.26 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  25.17 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  25.17 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  25.17 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  25.17 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  25.17 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.17 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  25.86 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  28.07 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  25.68 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.76 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  24.41 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.21 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  24.84 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.81 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  25.68 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  24.92 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  26.21 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  24.91 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  24.39 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  24.91 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  24.39 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  26.03 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.62 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  26.03 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  26.96 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.18 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  24.91 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  24.91 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  28.42 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  25.68 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  24.41 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  24.04 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  26.3 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  25.38 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  24.04 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  23.33 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  24.22 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.11 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  24 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
322 aa  72  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.18 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  24.01 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.08 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  25.3 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  24.56 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  26.85 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  22.96 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  26.53 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.89 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  25.51 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25.75 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.75 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  25 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  24.4 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  25.44 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.85 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1960  putative regulatory protein  22.62 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000520335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1789  putative regulatory protein, DeoR family  22.62 
 
 
408 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1495  putative regulatory protein  22.62 
 
 
408 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.943692  hitchhiker  0.0000000000000150767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1516  putative regulatory protein  22.62 
 
 
408 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115936  hitchhiker  0.000000147446 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  23.29 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  25.08 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.06 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.7 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  24.84 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>