129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0041 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0041  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0133  ribokinase-like domain-containing protein  39.57 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  28.57 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  32 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  40.7 
 
 
318 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.25 
 
 
322 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.33 
 
 
310 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  20.63 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
319 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  41.1 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  26.98 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  26.59 
 
 
628 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  39.44 
 
 
314 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  24.1 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  24.81 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3200  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  26.7 
 
 
476 aa  48.9  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.923411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  36.25 
 
 
304 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  31.58 
 
 
302 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.92 
 
 
315 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  30.39 
 
 
353 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.92 
 
 
315 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  35.82 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  35.94 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  26.59 
 
 
628 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  21.46 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  25.88 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.68 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  26.95 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.35 
 
 
315 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  32.1 
 
 
301 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  24.07 
 
 
301 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.35 
 
 
315 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.54 
 
 
306 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  32.86 
 
 
305 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  34.38 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  22.69 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  20.57 
 
 
320 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  26.13 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.35 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  29.9 
 
 
323 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 
317 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  32.1 
 
 
327 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3086  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.63 
 
 
476 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.521766  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0886  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.63 
 
 
476 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.685525  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  27.38 
 
 
335 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  35.29 
 
 
304 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  25.15 
 
 
329 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0338  rfaE bifunctional protein  24.61 
 
 
346 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  41.67 
 
 
311 aa  45.4  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  29.36 
 
 
362 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  26.84 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  30.21 
 
 
319 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  37.74 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  25.1 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  26.84 
 
 
317 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  37.25 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.37 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  42.55 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  29.57 
 
 
362 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  35.48 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  26.71 
 
 
333 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  25.29 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.02 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  29.36 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  29.36 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  29.17 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  44.44 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  29.17 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  22.3 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.26 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.23 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  32 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  26.84 
 
 
317 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.69 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0912  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.73 
 
 
476 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.03 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  29.36 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  29.36 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  24.88 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  29.36 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  29.36 
 
 
362 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  26.62 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3745  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.73 
 
 
476 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1282  putative ribokinase  23.6 
 
 
345 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.331017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0849  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.73 
 
 
476 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  31.58 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3423  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.73 
 
 
476 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.42 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  24.9 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  28.89 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  35.38 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  27.17 
 
 
320 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0946  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.73 
 
 
476 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.770525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
330 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 
670 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0937  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  29.73 
 
 
476 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>