More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1010 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  42.76 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.66 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  42.64 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  37.75 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.57 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.11 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  35.49 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  37.59 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  33.66 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.12 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  36.36 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.67 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  37.95 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  36.39 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  37.71 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  39.77 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.33 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  35.14 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  40.55 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  38.54 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2012  PfkB domain protein  42.62 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0768209  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  37.86 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  43.02 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.81 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.85 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  37.46 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35.67 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  37.1 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  37.92 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  35.81 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.04 
 
 		 345 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  37.25 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  36.15 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  35.55 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  31.1 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  39.76 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  35.99 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.26 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  40.36 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.03 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  37.16 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  37.46 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  36.03 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  40.08 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  35.84 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  33.11 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  36.49 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  37.94 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.4 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  36.49 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.33 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  36.08 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.68 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  37.67 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  36.12 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  35.74 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  36.27 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  43.81 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  36.86 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  37.23 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  35.99 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  36.27 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  36.27 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  35.74 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  36.27 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  35.74 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  35.99 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  36.86 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  35.92 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  36.21 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  40.15 
 
 		 322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  35.56 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  37.07 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  36.49 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  37.23 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  37.64 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  37.64 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  31.8 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  34.34 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  43.3 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  43.3 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  35.16 
 
 		 305 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  43.8 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  37.26 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  35.21 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  39.92 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  38.97 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  37.46 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  38.11 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  35.02 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>