More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1534 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  55.74 
 
 		 327 aa  335  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  53.54 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  44.18 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  41.64 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  46.94 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  44.26 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1216  carbohydrate kinase ribokinase family protein  42.12 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2877  ribokinase-like domain-containing protein  43.49 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  40.8 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  38.93 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  39.93 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  40.6 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.62 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.67 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  41.06 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  36.09 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  37.16 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  39.74 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  38.94 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  38.94 
 
 		 314 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  38.94 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  39.07 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  38.61 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  38.56 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  38.41 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  38.41 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.04 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  38.41 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.67 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  38.59 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.94 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  37.71 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.04 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.21 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  37.85 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  38.74 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  36.03 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  36.72 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  36.36 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  37 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  34.23 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.71 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  36.27 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.93 
 
 		 307 aa  145  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  32.49 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  35.64 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  32.9 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  36.33 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  36.33 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  36.21 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.85 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  35.99 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  35.64 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  36.3 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  35.64 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  35.64 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  35.86 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.39 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  36.39 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  37.12 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  37.41 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  33.56 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  36.95 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  34.93 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  33.56 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  36.05 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  34.75 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  37.07 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  35.71 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  35.71 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  31.4 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  36.91 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  33.56 
 
 		 309 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.13 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  37.25 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  35.35 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  32.09 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36.36 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  31.88 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.03 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.08 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  30.98 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  35.15 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  34.34 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  34.98 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  34.11 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  31.85 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>