More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1622 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  100 
 
 
297 aa  595  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  41.64 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  39.93 
 
 
327 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  39.59 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  36.82 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  36 
 
 
290 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  37.5 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  33.89 
 
 
302 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  35.64 
 
 
309 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  38.38 
 
 
305 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  33 
 
 
302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  34.38 
 
 
305 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32 
 
 
306 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  35.59 
 
 
301 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33 
 
 
302 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  33.33 
 
 
302 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  35.02 
 
 
289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  35.62 
 
 
308 aa  155  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  36.18 
 
 
305 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  33.11 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.34 
 
 
311 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  34 
 
 
305 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32.78 
 
 
308 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  32.33 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  34.68 
 
 
305 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  35.18 
 
 
307 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  32.67 
 
 
311 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.21 
 
 
304 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.21 
 
 
304 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  33.44 
 
 
297 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  32.67 
 
 
311 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  32.67 
 
 
311 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  32.8 
 
 
317 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  34.22 
 
 
309 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2877  ribokinase-like domain-containing protein  32.88 
 
 
284 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  32.07 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.02 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  31.77 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1216  carbohydrate kinase ribokinase family protein  31.51 
 
 
284 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.46 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  33.67 
 
 
307 aa  145  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  32.33 
 
 
310 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  32.78 
 
 
299 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  32.89 
 
 
304 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  32.67 
 
 
312 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  32.45 
 
 
307 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  33.89 
 
 
309 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  32.69 
 
 
306 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  31.23 
 
 
340 aa  142  9e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  32.89 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.81 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  31.6 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  31.56 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  33.9 
 
 
310 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  34.23 
 
 
303 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  32.37 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  31.08 
 
 
297 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30.45 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02480  ATP binding protein, putative  32.39 
 
 
315 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  33.66 
 
 
307 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  32.68 
 
 
308 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  31.37 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 
306 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  35.31 
 
 
333 aa  136  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  29.24 
 
 
345 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  30.43 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  32.04 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  31.02 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  30.69 
 
 
316 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  31.44 
 
 
302 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  31.91 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  30.32 
 
 
302 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  31 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  32.35 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  33.68 
 
 
403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  32.33 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  32.79 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  32.35 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  30.82 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  31.86 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.54 
 
 
307 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  33 
 
 
299 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  28.38 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  34.11 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  30.36 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  30.36 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  30.36 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  30.36 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  30.36 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  34.11 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  34.11 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  28.62 
 
 
321 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  34.11 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  31.15 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  28.28 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  31.86 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>