More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1142 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  100 
 
 		 310 aa  617  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  51.64 
 
 		 305 aa  305  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  50.99 
 
 		 305 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  34.6 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  31.4 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  29.35 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.04 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  31.58 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.13 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  31.76 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  32.48 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.39 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.9 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25.81 
 
 		 290 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.94 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  35.62 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  29.18 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.08 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.44 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  31 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  29.84 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  29.49 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.57 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.41 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  29.47 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  32.85 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  29.85 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.08 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.85 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  27.88 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.13 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  27.15 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.99 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  27.15 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  29.43 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  30.46 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  27.15 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  27.15 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.24 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  23.4 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  26.02 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.91 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  26.82 
 
 		 404 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  25.96 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  29.57 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  30.83 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.87 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.57 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.76 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  26.73 
 
 		 645 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.57 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  23.81 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.22 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.42 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.57 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  27.36 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  25.16 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.4 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.84 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  28.21 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  27.76 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  31.4 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  28.52 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  29.33 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  30.35 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  25.49 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  27.48 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.02 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  23.81 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  28.9 
 
 		 338 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.21 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.57 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  27.52 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.57 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.31 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.22 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  29.47 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  25.25 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.22 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.97 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.45 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.85 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  28.43 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  25.94 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.22 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  26.93 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  26.9 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  27.33 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.92 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.91 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  26.09 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>