More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4692 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  100 
 
 		 307 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  36.18 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  36.86 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  41.16 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  31.48 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  31.48 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  31.8 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.87 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  31.15 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  31.15 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  29.84 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  31.54 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.99 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  30.45 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  36.59 
 
 		 823 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2607  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000945109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1520  PfkB domain protein  32.48 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.395402  normal  0.0514354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  30.82 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  32.23 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 373 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2767  putative carbohydrate kinase  31.7 
 
 		 385 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.634409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  26.49 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  29.33 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  31.32 
 
 		 327 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 636 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 633 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.36 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  29.64 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  33 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.58 
 
 		 330 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  30.32 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  25.93 
 
 		 340 aa  86.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  31.05 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 330 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  35 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  32 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.69 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  32.66 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  25.54 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  30.83 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  32.9 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.09 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.07 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  30.93 
 
 		 645 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2897  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.84 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  31.89 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  30.31 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  28.52 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.67 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  30.96 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  34.97 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  34.34 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  28.91 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  32.01 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.71 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  24.34 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.98 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.51 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  24.34 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.81 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.1 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.46 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  30.8 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  29.33 
 
 		 634 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.65 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 640 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  30.64 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 646 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  31.65 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.21 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  29.22 
 
 		 642 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  31.52 
 
 		 635 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  35 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.56 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.88 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.29 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.6 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  32.77 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  33.1 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  28.33 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>