More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05321 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  100 
 
 
333 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  96.4 
 
 
333 aa  648    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  87.09 
 
 
334 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  74.85 
 
 
338 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  51.25 
 
 
335 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  50.62 
 
 
335 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  49.69 
 
 
342 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  47.89 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.35 
 
 
338 aa  329  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  47.29 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  43.41 
 
 
407 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  42.14 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  40.38 
 
 
330 aa  279  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  40.38 
 
 
330 aa  279  5e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  41.51 
 
 
331 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  41.43 
 
 
328 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  42.37 
 
 
335 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  39.63 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  41.49 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  40.56 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  45.6 
 
 
329 aa  272  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  40.5 
 
 
333 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  40.25 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 
330 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  40.94 
 
 
330 aa  265  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  38.75 
 
 
330 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  39.32 
 
 
333 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  38.91 
 
 
337 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
331 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  38.7 
 
 
330 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  38.7 
 
 
330 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  38.79 
 
 
337 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  39.75 
 
 
331 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  39.39 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  39.39 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  38.08 
 
 
333 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  38.87 
 
 
332 aa  256  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  41.9 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  36.84 
 
 
338 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  40.37 
 
 
333 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  36.65 
 
 
338 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  37.89 
 
 
333 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  37.54 
 
 
331 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  36.09 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  38.12 
 
 
331 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  37.14 
 
 
333 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  38.22 
 
 
328 aa  229  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 
330 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  34.15 
 
 
330 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
330 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  34.36 
 
 
335 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  35.83 
 
 
341 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.44 
 
 
336 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 
330 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.65 
 
 
331 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  34.97 
 
 
327 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  34.97 
 
 
327 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  34.78 
 
 
339 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.23 
 
 
328 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  34.16 
 
 
339 aa  186  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 
333 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
328 aa  176  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  31.23 
 
 
370 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  28.44 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 
334 aa  158  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.78 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.79 
 
 
304 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  29.96 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.22 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  27 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  28.78 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  26.02 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  27.88 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  25.23 
 
 
302 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  25.52 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  24.16 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.52 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  23.38 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  23.38 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  24.04 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 
305 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  21.61 
 
 
347 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  23.08 
 
 
332 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  26.67 
 
 
319 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  22.88 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.15 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  25.82 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  25.09 
 
 
303 aa  86.7  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.81 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  26.88 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.14 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.2 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  25.41 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.77 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  25.87 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.1 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  23.25 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.77 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.77 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>