More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4013 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 315 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  31.13 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  31.4 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.73 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.37 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  32.17 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  33.57 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  32.16 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  32.17 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  32.17 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  29.17 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  32.17 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  32.17 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.11 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  31.82 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  32.59 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  28.77 
 
 		 320 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  29.45 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  30.67 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.11 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  29.64 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  28.07 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.78 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.16 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  30.03 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  30 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.07 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.14 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.17 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  31.16 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  32.35 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  30.97 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.66 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.59 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  26.04 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.4 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.4 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.4 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.4 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.4 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  29.66 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  30.9 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.8 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  26.62 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  26.92 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.08 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  29.35 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.32 
 
 		 302 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  27.61 
 
 		 645 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  29.41 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  24.92 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  26.35 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  28.8 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  24.16 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  30.74 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  29.56 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  30.57 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  26.18 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  29.01 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  29.01 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  27.61 
 
 		 645 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  25.89 
 
 		 652 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.72 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  29.08 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.56 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  31.92 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  28.25 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  30.56 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  31.25 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  24.27 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  33.8 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.9 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  29.1 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  28.04 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.14 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  33.06 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.48 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  29.25 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.24 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  25.47 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25.24 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  25.1 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>