More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_75489 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  100 
 
 		 333 aa  677    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  32.93 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  32.84 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.14 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  34.83 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  33.33 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  34.05 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  33.94 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  32.73 
 
 		 308 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  33.54 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  32.24 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  33.44 
 
 		 302 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32.21 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  31.93 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  32.53 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  32.54 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33.44 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  33.94 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  33.64 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  33.64 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  33.74 
 
 		 290 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.33 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  33.33 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  33.64 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.64 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  32.73 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  33.03 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  34.53 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  35.37 
 
 		 297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  32.34 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  33.74 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  32.7 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  33.33 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  34.15 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  32.32 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  30.63 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  33.93 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  32.52 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  31.27 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  32.92 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  32.52 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  33.23 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  33.23 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  31.19 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  31.19 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  34.25 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  31.19 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  31.19 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  31.19 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  33.53 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  33.84 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  31.9 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  33.13 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  31.45 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  32.84 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  31.71 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  32.12 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  33.23 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  32.72 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  32.62 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  31.35 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  32.54 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  33.13 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  30.25 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  30.82 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  32.33 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  32.41 
 
 		 320 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  32.44 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  29.55 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.03 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  33.64 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  31.4 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  31.21 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  31.4 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  31.4 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  32.04 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  32.04 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  30.28 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  31.19 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  33.33 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  30.24 
 
 		 404 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  32.93 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  32.63 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  33.94 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  32.44 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  32.04 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  33.64 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  31.93 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  31.93 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  31.64 
 
 		 303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  31.14 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  31.17 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  29.94 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  29.94 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  29.94 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  31.44 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  29.94 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>