More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0646 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  92.99 
 
 		 328 aa  637    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  677    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  96.04 
 
 		 328 aa  651    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  27.64 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  26.87 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.92 
 
 		 311 aa  89.4  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.33 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  25.15 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25.15 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  25.47 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  27.83 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.39 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 304 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  26.39 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  27.4 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.17 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  27.35 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  26.19 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  24.82 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  25.4 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  25 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.78 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  24.11 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  27.07 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.68 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.46 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.46 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.46 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  24.31 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.46 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  24.58 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.46 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.46 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.46 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.4 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  23.99 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.16 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  26.99 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  24.23 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  22.84 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  24.04 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  21.41 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  21.09 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.99 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  23.17 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.44 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  25.65 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  21.02 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  25.27 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.93 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  25.96 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  25.64 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  25.48 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  25.64 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  25.39 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  21.86 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.73 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  24.21 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  26.27 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  25.67 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  25.82 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  25.94 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  24.92 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  24.73 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  21.66 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  23.49 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  24.57 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  25.65 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  23.69 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  22.55 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  24.46 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1176  PfkB domain protein  32.23 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.156952  normal  0.0586997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  23.57 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  26.33 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  22.08 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  23.91 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  24.36 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.41 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  22.39 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  23.25 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  21.83 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  23.58 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  23 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  22.68 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  25.76 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  25.76 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>