More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0147 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  629  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  51.82 
 
 
304 aa  293  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  49.5 
 
 
305 aa  290  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  49.83 
 
 
302 aa  263  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 
310 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  35.59 
 
 
291 aa  125  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.36 
 
 
311 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
308 aa  122  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  34.67 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  32.12 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  30.97 
 
 
305 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  33.98 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  29.55 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  29.26 
 
 
308 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.66 
 
 
315 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  28.43 
 
 
306 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27 
 
 
304 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  27 
 
 
304 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.74 
 
 
307 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  30.79 
 
 
302 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  29.13 
 
 
309 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.32 
 
 
306 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.32 
 
 
306 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.32 
 
 
306 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.32 
 
 
306 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  29.61 
 
 
295 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.32 
 
 
306 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  30.46 
 
 
298 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  29.14 
 
 
403 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  29.58 
 
 
310 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  26.77 
 
 
306 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 
315 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  29.58 
 
 
310 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  30.87 
 
 
289 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  31.21 
 
 
295 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.45 
 
 
302 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  28.15 
 
 
309 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  28.25 
 
 
424 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  30.29 
 
 
298 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.9 
 
 
308 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  30.56 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.71 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.16 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.26 
 
 
306 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.23 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  29.97 
 
 
298 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  29.97 
 
 
298 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  29.97 
 
 
298 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  29.97 
 
 
298 aa  99  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  29.28 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.22 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  27.72 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  25.48 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  29.33 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.15 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  25.48 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  29.32 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.67 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  29.13 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  29.28 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  28.52 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  29.64 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  26.56 
 
 
353 aa  95.9  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  28.99 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  28.4 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  28.16 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  28.4 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  28.48 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.39 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  27.12 
 
 
344 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  23.95 
 
 
328 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  29.25 
 
 
317 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  27.12 
 
 
310 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.12 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  25.49 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.97 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  27.12 
 
 
310 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  31.51 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  27.57 
 
 
304 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  28.48 
 
 
308 aa  92  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  28.29 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  28.85 
 
 
309 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  31 
 
 
298 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  23.4 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  29.87 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  28.99 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.77 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  27.18 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  28.99 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  26.82 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>