More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2903 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  61.09 
 
 
300 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  45.48 
 
 
302 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  45.15 
 
 
302 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  44.82 
 
 
302 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  45.08 
 
 
298 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  45.67 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  43.69 
 
 
302 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  43.45 
 
 
299 aa  245  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  44.71 
 
 
294 aa  242  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  43.34 
 
 
298 aa  227  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  41.5 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
327 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  33.22 
 
 
308 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  32.96 
 
 
313 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  32.96 
 
 
313 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  31.88 
 
 
310 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  30.85 
 
 
311 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  32.13 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 
308 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 
312 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  30.24 
 
 
300 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  29.84 
 
 
320 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  32.45 
 
 
310 aa  122  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  32.01 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  31.13 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  30 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  31.19 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  29.96 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 
316 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 
298 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  30.04 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  29.66 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 
320 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  28.52 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  28.98 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  29.49 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  28.42 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  28.78 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  29.44 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  29.28 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  30.92 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  30.04 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  31.56 
 
 
310 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  29.28 
 
 
362 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  27.38 
 
 
311 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  27.55 
 
 
307 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  26.57 
 
 
315 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  28.86 
 
 
300 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  29.43 
 
 
283 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  29.43 
 
 
312 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  29.43 
 
 
312 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  29.43 
 
 
312 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  27 
 
 
311 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  29.06 
 
 
312 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  29.06 
 
 
312 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  29.06 
 
 
312 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  28.74 
 
 
301 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  28.14 
 
 
314 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  27 
 
 
311 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  28.68 
 
 
312 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  28.83 
 
 
312 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 
312 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  28.83 
 
 
312 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  29.25 
 
 
325 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  28.92 
 
 
325 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  30.23 
 
 
328 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  28.62 
 
 
317 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  30.11 
 
 
324 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  26.28 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  27.82 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  27.53 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  25.65 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  27.92 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  28.36 
 
 
323 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  28.22 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  27.34 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  25.86 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  29.35 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  28.66 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  28.36 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  29.82 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  29.3 
 
 
329 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.37 
 
 
345 aa  93.2  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.35 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  28.42 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  26.26 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  28.24 
 
 
329 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  27.21 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  27.21 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  27.21 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.39 
 
 
313 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.39 
 
 
313 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.39 
 
 
313 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  28 
 
 
326 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>