More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0660 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  37.05 
 
 
319 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  36.86 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5796  PfkB domain protein  33.23 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
304 aa  112  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  34.27 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.73 
 
 
315 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.73 
 
 
315 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.73 
 
 
315 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.73 
 
 
315 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.73 
 
 
315 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
315 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.73 
 
 
315 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.9 
 
 
305 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  27.93 
 
 
319 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  29.23 
 
 
310 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  32 
 
 
823 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.1 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.25 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.24 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.07 
 
 
329 aa  89.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  30.95 
 
 
332 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  29.8 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  28.57 
 
 
327 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  28.3 
 
 
630 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.58 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 
322 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  23.3 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  28 
 
 
300 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  28.57 
 
 
327 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2294  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  26.63 
 
 
645 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  28.24 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  26.99 
 
 
330 aa  85.9  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  29.86 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.81 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  29.67 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.34 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  26.03 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  30.2 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  27.17 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  27.56 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2589  PfkB domain protein  30.36 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  29.37 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  26.33 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.64 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  28.81 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.32 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  30 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  24.01 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.69 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  28.24 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  27.39 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  29.8 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  29.8 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  29.8 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  29.8 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  29.8 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  27.86 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  28.8 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  27.8 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  30.39 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.76 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  27.88 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  28.75 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.33 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.48 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  30.87 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  28.12 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.59 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  28.48 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.91 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  26.52 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  26.52 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  27.51 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  27.01 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  26.21 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.71 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  28.85 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  26.54 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  29.22 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.29 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  28.67 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.16 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  25.66 
 
 
297 aa  79  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  25.09 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  26.67 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.75 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>