More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1307 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  100 
 
 		 338 aa  693    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  51.55 
 
 		 330 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  50.47 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  50.47 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  50 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  52.01 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  50.46 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  51.06 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  48.93 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 331 aa  311  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  51.26 
 
 		 407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  48.15 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  48.15 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  49.85 
 
 		 333 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  49.69 
 
 		 333 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  51.67 
 
 		 337 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  53.94 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  49.85 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  50.76 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  50.76 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  49.69 
 
 		 333 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  51.85 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  52.28 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  49.54 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  50.91 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  49.54 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  47.55 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  48.19 
 
 		 333 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  48.6 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  49.08 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  43.87 
 
 		 335 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  43.56 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  47.4 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.98 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  46.91 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  47.37 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.7 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  46.95 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  47.81 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.19 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  43.93 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  44.95 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  43.67 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  37.35 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  37.38 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  36.84 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  37.35 
 
 		 333 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  42.59 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  38.49 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  38.49 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  39.38 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  36.56 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 331 aa  165  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  32.6 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  28.88 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 330 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  32.14 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  31.65 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.8 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  34.78 
 
 		 273 aa  104  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.35 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.41 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.72 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32.09 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  30.48 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  27.19 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  32.23 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 		 302 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.86 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  31.73 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  32.6 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.93 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  30.8 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.26 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  28.89 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  27.83 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.15 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  40.91 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.82 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  30.29 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.53 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  26.79 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  27.07 
 
 		 645 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  28.77 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  30.18 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  27.76 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  30.63 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0647  inosine-guanosine kinase  26.09 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.243174  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.28 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>