More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1668 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  100 
 
 
337 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  84.91 
 
 
338 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  74.77 
 
 
342 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  61.11 
 
 
348 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  57.85 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  56.62 
 
 
335 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  53.43 
 
 
407 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  47.29 
 
 
333 aa  348  9e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  52.91 
 
 
335 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  45.76 
 
 
338 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  47.56 
 
 
334 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  46.99 
 
 
333 aa  342  4e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  50.15 
 
 
330 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  50.15 
 
 
330 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  50.94 
 
 
328 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  51.25 
 
 
331 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  51.7 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  50.95 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  52.94 
 
 
333 aa  335  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  49.53 
 
 
330 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  50.3 
 
 
338 aa  331  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  51.99 
 
 
333 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  49.85 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  47.96 
 
 
330 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  50 
 
 
330 aa  326  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  48.28 
 
 
330 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  50.15 
 
 
337 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  49.85 
 
 
337 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  49.85 
 
 
337 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  48.78 
 
 
332 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  49.69 
 
 
337 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  50.32 
 
 
330 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  49.24 
 
 
333 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  48.93 
 
 
333 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  49.08 
 
 
331 aa  315  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  51.39 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  49.39 
 
 
331 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  49.24 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  47.55 
 
 
329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  47.85 
 
 
338 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  49.22 
 
 
333 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  47.53 
 
 
331 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  48.29 
 
 
330 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.98 
 
 
330 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  48.72 
 
 
330 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.07 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  46.58 
 
 
330 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  40.31 
 
 
330 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  44.13 
 
 
333 aa  259  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  40.06 
 
 
335 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  38.63 
 
 
327 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  37.88 
 
 
330 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  38.63 
 
 
327 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 
333 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  37.46 
 
 
328 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  36.14 
 
 
336 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.4 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  33.54 
 
 
328 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 
341 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.33 
 
 
339 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  34.92 
 
 
370 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  34.71 
 
 
360 aa  159  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 
334 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  32.22 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  34.33 
 
 
273 aa  90.1  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.54 
 
 
300 aa  87  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.13 
 
 
642 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  25.07 
 
 
328 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  27.61 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.28 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.22 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  28.68 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  25.79 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.19 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2439  inosine-guanosine kinase  28.03 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0642312  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.68 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  25.35 
 
 
645 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.73 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  26.84 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2247  inosine-guanosine kinase  28.03 
 
 
434 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000474841  normal  0.0326769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  28.03 
 
 
644 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  28.47 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  25.15 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  26.22 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.44 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  25.36 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.43 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  27.49 
 
 
642 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2319  inosine-guanosine kinase  27.27 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000788417  unclonable  0.0000471169 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.05 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  25.48 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.05 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2295  inosine kinase  26.57 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000546869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2020  inosine-guanosine kinase  26.57 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>