118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2845 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2020  inosine-guanosine kinase  87.79 
 
 
434 aa  805    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003853  inosine-guanosine kinase  68.66 
 
 
434 aa  642    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1431  inosine kinase  87.1 
 
 
434 aa  805    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2247  inosine-guanosine kinase  86.41 
 
 
434 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000474841  normal  0.0326769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2319  inosine-guanosine kinase  86.41 
 
 
434 aa  799    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000788417  unclonable  0.0000471169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1541  inosine kinase  85.94 
 
 
434 aa  795    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2439  inosine-guanosine kinase  86.18 
 
 
434 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0642312  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1317  inosine kinase  83.41 
 
 
434 aa  772    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.110891  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2544  inosine kinase  87.56 
 
 
434 aa  804    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.247957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2228  inosine kinase  89.63 
 
 
434 aa  796    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216466  hitchhiker  0.00128428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2295  inosine kinase  87.33 
 
 
434 aa  801    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000546869  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0647  inosine-guanosine kinase  68.2 
 
 
434 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.243174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2582  inosine kinase  87.56 
 
 
434 aa  804    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01826  inosine kinase  68.2 
 
 
434 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  100 
 
 
434 aa  904    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1530  inosine kinase  89.17 
 
 
442 aa  792    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00064994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2659  inosine kinase  87.56 
 
 
434 aa  804    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0486522  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1799  inosine kinase  92.17 
 
 
434 aa  826    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00398478  hitchhiker  0.000000265344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1802  Inosine kinase  87.56 
 
 
434 aa  804    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0521986  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1847  inosine-guanosine kinase  66.59 
 
 
434 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.324608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00428  inosine/guanosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3133  Inosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.838114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00433  hypothetical protein  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0554  inosine-guanosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0516  inosine-guanosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.812213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3139  inosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0521  inosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0701891  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0409  inosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0569  inosine kinase  67.28 
 
 
434 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1144  inosine kinase  65.67 
 
 
434 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.956957  unclonable  0.0000000331815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0543  inosine kinase  65.44 
 
 
434 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0598  inosine kinase  65.44 
 
 
434 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.366249  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0553  inosine kinase  65.44 
 
 
434 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0537  inosine kinase  65.44 
 
 
434 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0538  inosine kinase  65.21 
 
 
434 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0956  inosine-guanosine kinase  64.29 
 
 
434 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3035  inosine-guanosine kinase  64.75 
 
 
434 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0618188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1258  inosine-guanosine kinase  64.75 
 
 
434 aa  609  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000666665  hitchhiker  0.00000119975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3176  inosine kinase  64.75 
 
 
434 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.706917  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0500  inosine-guanosine kinase  63.82 
 
 
434 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05942  inosine-guanosine kinase  61.75 
 
 
434 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0433  inosine-guanosine kinase  62.44 
 
 
434 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.355559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000207  inosine-guanosine kinase  60.14 
 
 
434 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.471058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  58.99 
 
 
432 aa  528  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 
337 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  28 
 
 
407 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  27.55 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  27.17 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  24.55 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  26.85 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  26.36 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  26.22 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  26.25 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  27.63 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  27.66 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  24.19 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  26.26 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  27.24 
 
 
333 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  26.11 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  27.82 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  28.4 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  29.27 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  27.82 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  25.89 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  21.93 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  25.34 
 
 
336 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  28.03 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  27.11 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  26.64 
 
 
333 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  28.81 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.86 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  27.71 
 
 
337 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  25.21 
 
 
338 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  26.32 
 
 
333 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  23.93 
 
 
370 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  28.12 
 
 
330 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  26.22 
 
 
333 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  25.76 
 
 
333 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
330 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  25.65 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  25.7 
 
 
330 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  25.5 
 
 
330 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 
333 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  24.02 
 
 
333 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  25.81 
 
 
331 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  25.28 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  25.77 
 
 
327 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  25.77 
 
 
327 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  24.11 
 
 
333 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  23.1 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  26.32 
 
 
330 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.93 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  22.27 
 
 
330 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  26.7 
 
 
330 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 
330 aa  54.3  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>