More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05631 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  97.01 
 
 
335 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  100 
 
 
335 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  58.64 
 
 
342 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  56.08 
 
 
338 aa  384  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  57.54 
 
 
348 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  52.01 
 
 
338 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  56.62 
 
 
337 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  50.62 
 
 
333 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  50.94 
 
 
333 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  50.62 
 
 
334 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  50.15 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  48.42 
 
 
337 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  49.06 
 
 
328 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  45.68 
 
 
333 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  47.13 
 
 
330 aa  298  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  44.11 
 
 
337 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  46.71 
 
 
335 aa  295  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  44.82 
 
 
337 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  45.03 
 
 
333 aa  295  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  43.5 
 
 
337 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  43.5 
 
 
337 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  44.41 
 
 
330 aa  292  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  44.51 
 
 
330 aa  288  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  44.51 
 
 
330 aa  288  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  45.31 
 
 
331 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  44.58 
 
 
331 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  45.31 
 
 
331 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  45.4 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  45.91 
 
 
329 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  44.48 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  45.14 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  46.11 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  45.45 
 
 
332 aa  281  8.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  43.22 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  43.73 
 
 
333 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  43.87 
 
 
338 aa  278  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  41.98 
 
 
333 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  42.94 
 
 
333 aa  272  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  45.68 
 
 
331 aa  270  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  42.38 
 
 
333 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  42.07 
 
 
333 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.01 
 
 
330 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  41.85 
 
 
330 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  41.85 
 
 
330 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  40.55 
 
 
333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  42.41 
 
 
330 aa  252  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  41.18 
 
 
333 aa  252  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  38.84 
 
 
331 aa  242  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  45.14 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.84 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  38.82 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.84 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  36.48 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.62 
 
 
336 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  37.99 
 
 
333 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  33.87 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.94 
 
 
331 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.18 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  32.83 
 
 
370 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
328 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.35 
 
 
360 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  30.43 
 
 
339 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 
334 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  29.94 
 
 
339 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.39 
 
 
317 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.05 
 
 
305 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  24.62 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.47 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  28.63 
 
 
297 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.48 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  25.6 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.16 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.42 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.81 
 
 
302 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  23.31 
 
 
305 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  28.35 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  27.55 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.51 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  29.1 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  27.27 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  30.18 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.1 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  26.36 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1847  inosine-guanosine kinase  27.13 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.324608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  25.96 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.9 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  30.47 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  27.69 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  27.61 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.2 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.42 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1431  inosine kinase  25.84 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05942  inosine-guanosine kinase  26.67 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.69 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.46 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  26.85 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.13 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>