More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0055 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  673    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  39.56 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 328 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  30.91 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  36.42 
 
 		 407 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  33.12 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  33.12 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  33.63 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  36.28 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  32.7 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  35.22 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  33.12 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  32.8 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  34.06 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  33.02 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  30.6 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  29.02 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  30.5 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  27.88 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  34.78 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  32.28 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  35.61 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  31.33 
 
 		 342 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  35.28 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  33.83 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  30.48 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  33.75 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  32.38 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  33.23 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  33.53 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  34.56 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  34.59 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  34.28 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  33.23 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  33.96 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  33.44 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  28.36 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  29.97 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  30.79 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  34.92 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  30.82 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  27.99 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  30.54 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  33.44 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  28.92 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  33.04 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  29.72 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  29.88 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  27.41 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  33.07 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  32.81 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.14 
 
 		 297 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  31.65 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.11 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  32.67 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  31.54 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.54 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  28.67 
 
 		 312 aa  86.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  33.88 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  29.3 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.99 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.41 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  30.51 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  28.33 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  25.65 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  28.77 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  30.65 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  30.04 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.36 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  28.18 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  27.83 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  27.97 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  29.44 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  28.05 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.37 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  25.29 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>