More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2568 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  53.05 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  52.71 
 
 
331 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  46.01 
 
 
335 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  44.58 
 
 
407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  44.48 
 
 
333 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  42.9 
 
 
333 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  42.68 
 
 
330 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  42.68 
 
 
330 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  45.95 
 
 
333 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  41.9 
 
 
330 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  38.23 
 
 
348 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  44.26 
 
 
333 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  41.9 
 
 
331 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  41.64 
 
 
342 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  43.53 
 
 
337 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  41.01 
 
 
333 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  41.53 
 
 
330 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  43.79 
 
 
331 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  41.87 
 
 
337 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  44.75 
 
 
338 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  41.64 
 
 
333 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  39.24 
 
 
330 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  40.66 
 
 
337 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  40.66 
 
 
337 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  42.32 
 
 
333 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  43.12 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  43.84 
 
 
333 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  43.17 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  41.4 
 
 
331 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  40.19 
 
 
330 aa  218  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  37.99 
 
 
335 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  40.48 
 
 
330 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  37.58 
 
 
335 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  40.18 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  44.34 
 
 
330 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  44.34 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  42.31 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  43.56 
 
 
330 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  42.41 
 
 
337 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  39.87 
 
 
338 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  42.95 
 
 
333 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  40.62 
 
 
328 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  39.31 
 
 
338 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  40.19 
 
 
337 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  32.8 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  42.63 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  32.52 
 
 
333 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  31.99 
 
 
334 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  32.52 
 
 
333 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  38.53 
 
 
335 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  32.08 
 
 
336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  34.7 
 
 
328 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  32.49 
 
 
330 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  31.1 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  31.1 
 
 
327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  32.7 
 
 
370 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  32.09 
 
 
331 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  31.27 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  36.71 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 
328 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  27.94 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  27.78 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32.18 
 
 
303 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.44 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  31.65 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.07 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.23 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  32.69 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  31.09 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  34.45 
 
 
316 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.8 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.73 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.15 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.42 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.36 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  30.6 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.86 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.2 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  30.74 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  28.04 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  32.59 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  31.75 
 
 
357 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.99 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  29.96 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.41 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.79 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  29.79 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.23 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  25.84 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  30.88 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  28.95 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57331  adenosine kinase  25.36 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>