More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2022 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  56 
 
 		 335 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  53.94 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  51.7 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  48.77 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  48.77 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  48.17 
 
 		 330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  53.8 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  52.06 
 
 		 332 aa  308  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  48.29 
 
 		 331 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  48.89 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  54.01 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  49.04 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  48.25 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  50.78 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  53.56 
 
 		 331 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  50.62 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  50.92 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  48.8 
 
 		 337 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  48.8 
 
 		 337 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  49.52 
 
 		 342 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  49.7 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  51.96 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  51.75 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  50.16 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  50.31 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  49.85 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  48.91 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  48.6 
 
 		 333 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  49.85 
 
 		 333 aa  288  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  49.54 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.3 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  47.04 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  43.73 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  48.25 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  41.4 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  41.4 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  41.77 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  48.34 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  45.45 
 
 		 335 aa  271  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  41.77 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  45.14 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  44.79 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  49.24 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  43.43 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  43.52 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  43.65 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  44.27 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  44.23 
 
 		 333 aa  222  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  41.49 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  41.9 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  35.65 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  30.41 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  35.98 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.13 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  35.65 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  33.12 
 
 		 370 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  32.82 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.58 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32.27 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.04 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  33.33 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  33.05 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.17 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  31.08 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  32.37 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  26.64 
 
 		 644 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.49 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  26.99 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  31.11 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  28.84 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  24.11 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  30.22 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.04 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.91 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  25.82 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  33.82 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  27.98 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  24.57 
 
 		 655 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  33.21 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  24.78 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  28.35 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  31.6 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.94 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.99 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 670 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.65 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>