More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5895 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  100 
 
 
304 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  48.98 
 
 
308 aa  242  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  42.37 
 
 
317 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  41.84 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  41.84 
 
 
319 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  44.22 
 
 
300 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 
314 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  39.93 
 
 
316 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  39.59 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  40.61 
 
 
320 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  39.25 
 
 
319 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  37.46 
 
 
313 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.36 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  29.81 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  29.81 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  29.81 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.59 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.59 
 
 
313 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  32.63 
 
 
317 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.24 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.42 
 
 
315 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.08 
 
 
315 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.08 
 
 
315 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.08 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.08 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.08 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.42 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.08 
 
 
301 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  33.56 
 
 
302 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  31.86 
 
 
304 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  30.82 
 
 
320 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 
304 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.26 
 
 
311 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  30.49 
 
 
320 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.43 
 
 
323 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  31.49 
 
 
344 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.82 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  29.1 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  29.68 
 
 
302 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  30.94 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  30.94 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  30.19 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  31.61 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  33.85 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.75 
 
 
338 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.16 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.22 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  26.22 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  30.61 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  26.92 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  27.02 
 
 
334 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  29.77 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  30.99 
 
 
308 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  24.07 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  28.52 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.67 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  33.79 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.41 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  29.9 
 
 
353 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  28.48 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.41 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  30.15 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  29.93 
 
 
314 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.49 
 
 
322 aa  89  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.8 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  31.55 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  26.39 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  30.37 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  26.91 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  23.79 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.41 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.21 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.1 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.45 
 
 
321 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.41 
 
 
315 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  27.69 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  27.76 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  33.46 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  26.13 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  25.33 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.79 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  29.03 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  26.71 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  25.33 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  27.3 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  30.74 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  25.33 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  25.33 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  25.33 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  27.66 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.85 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  24.16 
 
 
645 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  25.71 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  29.01 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>