More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0562 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  100 
 
 
328 aa  666    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  40.45 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  40.45 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  41.27 
 
 
328 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  40.32 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  40.12 
 
 
331 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  38.22 
 
 
333 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  38.22 
 
 
333 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  41.82 
 
 
333 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  38.78 
 
 
334 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 
330 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  42.45 
 
 
330 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  40.13 
 
 
330 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  41.19 
 
 
333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  38.05 
 
 
370 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  38.49 
 
 
331 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  35.9 
 
 
338 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  40.25 
 
 
330 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  39.37 
 
 
330 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  39.37 
 
 
330 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  39.62 
 
 
330 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  40.88 
 
 
333 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  39.12 
 
 
330 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  38.41 
 
 
333 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  38.54 
 
 
328 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  39.94 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  37.14 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  37.26 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  37.14 
 
 
330 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  40.57 
 
 
333 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  34.19 
 
 
335 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  33.87 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  35.19 
 
 
341 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  36.56 
 
 
338 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 
337 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  36.62 
 
 
342 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  35.78 
 
 
337 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  38.07 
 
 
332 aa  189  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 
338 aa  188  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  37.9 
 
 
407 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  39.56 
 
 
329 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  36.83 
 
 
338 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  36.79 
 
 
331 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
337 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  34.33 
 
 
339 aa  186  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  38.99 
 
 
333 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  34.56 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  37.77 
 
 
348 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  38.22 
 
 
331 aa  182  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 
337 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.94 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  37.78 
 
 
337 aa  178  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  35.22 
 
 
331 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  33.76 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  34.82 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  36.79 
 
 
335 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
335 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  30.91 
 
 
331 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  34.39 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  35.99 
 
 
330 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 
328 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  29.72 
 
 
360 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 
333 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  30.15 
 
 
334 aa  122  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.85 
 
 
317 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.32 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32.95 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.42 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  32.44 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  33.21 
 
 
321 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.71 
 
 
304 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  31.42 
 
 
298 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  31.32 
 
 
314 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.15 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  29.63 
 
 
298 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  30.38 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.29 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05942  inosine-guanosine kinase  28.14 
 
 
434 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  30.57 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  31.34 
 
 
309 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  27.9 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  27.9 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  27.9 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  27.9 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  25.89 
 
 
324 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  29.66 
 
 
317 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  28.41 
 
 
332 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.39 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.97 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  25.68 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000207  inosine-guanosine kinase  27 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.471058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  26.27 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.34 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  31.6 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.67 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.09 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>