More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3284 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  47.11 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  45.71 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  45.71 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  47.26 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  45.26 
 
 		 370 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  37.12 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  40.48 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  39.27 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  38.11 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  37.11 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  36.48 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  36.56 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  37.42 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  37.61 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  35.35 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  32.06 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  35.53 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  36 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  37.03 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  37.08 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  34.17 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  33.12 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  31.96 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  32.49 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  35.62 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  35.62 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  35.65 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  35.65 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  35.85 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  35.87 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  35.99 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  34.38 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  33.94 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  35.38 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  34.49 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  34.35 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  34.95 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  34.46 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  34.55 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  31.45 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  34.55 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  33.84 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  31.79 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  34.15 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  33.74 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  30.5 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  30.67 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  30.89 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  32.49 
 
 		 333 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.59 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.94 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.64 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.53 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.96 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  30.47 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.46 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.72 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.63 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  28.74 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  26.75 
 
 		 273 aa  86.3  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.99 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.15 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  30.32 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  27.68 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  27.93 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02130  adenosine kinase, putative  28.47 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.47 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  26.84 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  25.9 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  27.55 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  27.59 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.83 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  29.24 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  26.05 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  24.92 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.28 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  27.07 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  27.24 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  29.21 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  26.32 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>