More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0218 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  100 
 
 
333 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  90.36 
 
 
333 aa  583  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  79.15 
 
 
333 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  79.28 
 
 
333 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  81.68 
 
 
333 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  80.48 
 
 
333 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  80.78 
 
 
333 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  63.25 
 
 
335 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  65.65 
 
 
333 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  63.61 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  62.65 
 
 
331 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  62.96 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  59.06 
 
 
330 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  59.06 
 
 
330 aa  388  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  57.7 
 
 
337 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  58.91 
 
 
337 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  57.7 
 
 
337 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  58.98 
 
 
337 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  57.94 
 
 
331 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  56.17 
 
 
330 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  55.73 
 
 
337 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  56.06 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  54.63 
 
 
330 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  51.55 
 
 
330 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  52.94 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  53.5 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  52.32 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  52.74 
 
 
329 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  52.66 
 
 
342 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  52.76 
 
 
328 aa  324  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  52.32 
 
 
332 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  52.27 
 
 
331 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  50.15 
 
 
338 aa  309  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  51.39 
 
 
337 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  53.42 
 
 
330 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  48.93 
 
 
338 aa  295  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  49.54 
 
 
330 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  49.54 
 
 
330 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  42.51 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  42.94 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  43.57 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  40.75 
 
 
334 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  38.63 
 
 
338 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  39.32 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  39.01 
 
 
333 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  50.31 
 
 
330 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  42.38 
 
 
330 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  45.91 
 
 
333 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  42.24 
 
 
331 aa  245  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  44.16 
 
 
333 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  41.09 
 
 
335 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  39.94 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  36.09 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  34.81 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  33.97 
 
 
327 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  34.77 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.81 
 
 
328 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  36.19 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
330 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 
341 aa  165  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  32.82 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.13 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  36.36 
 
 
360 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.18 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.28 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  33.44 
 
 
300 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  32 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.95 
 
 
309 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.84 
 
 
303 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.21 
 
 
288 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.99 
 
 
297 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.51 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  27.62 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  26.76 
 
 
347 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.26 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.56 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.67 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.54 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.18 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  28.46 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  29.89 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  27.76 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  31.17 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  30.58 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  30.96 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  29.5 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  27.48 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  29.54 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  28.47 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  29.01 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.08 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.88 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.85 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.67 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  27.85 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  24.24 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.45 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>