More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1228 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  681    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  57.32 
 
 		 330 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  56.75 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  56.7 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  55.11 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  58.26 
 
 		 333 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  53.89 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  53.89 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  55.73 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  55.73 
 
 		 333 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  53.89 
 
 		 330 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  53.89 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  56.66 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  54.83 
 
 		 330 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  56.66 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  56.17 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  54.13 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  54.13 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  53.11 
 
 		 331 aa  341  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  54.43 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  55.73 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  54.43 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  53.48 
 
 		 342 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  53.87 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  53.94 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  53.5 
 
 		 329 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  54.8 
 
 		 333 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  51.26 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  53.66 
 
 		 333 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  48.1 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  47.88 
 
 		 348 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  48.42 
 
 		 335 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  51.24 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  51.86 
 
 		 331 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  50 
 
 		 338 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  50.95 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  50.15 
 
 		 332 aa  298  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  51.23 
 
 		 330 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  51.23 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  50.61 
 
 		 331 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  50.46 
 
 		 330 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  42.14 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  41.19 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  42.09 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  40.13 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  50.65 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  43.81 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  44.92 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  43.56 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  41.95 
 
 		 335 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  42.41 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  37.03 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.8 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  36.25 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  36.25 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  37.3 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  37.5 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  39.56 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  37.18 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  31.66 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.66 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  34.59 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  35.9 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.21 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.46 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.26 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  31.58 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.8 
 
 		 303 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.88 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  30.08 
 
 		 434 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  31.97 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  28.08 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1431  inosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  29.09 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  32.58 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  31.44 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  27.33 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  25.59 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  27.67 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.46 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1530  inosine kinase  27.76 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00064994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.07 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  29.82 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1317  inosine kinase  30.77 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.110891  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2228  inosine kinase  29.86 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216466  hitchhiker  0.00128428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2020  inosine-guanosine kinase  29.41 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1541  inosine kinase  28.05 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  30.04 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.02 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1799  inosine kinase  28.91 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00398478  hitchhiker  0.000000265344 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.5 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2659  inosine kinase  29.41 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0486522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2295  inosine kinase  29.41 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000546869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2544  inosine kinase  29.41 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.247957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>