More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1580 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  53.11 
 
 		 317 aa  325  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  54.15 
 
 		 320 aa  292  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  48.68 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  37.41 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  36.54 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  36.54 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.77 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  31.08 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  32.25 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.77 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  31.46 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  37.2 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  36.33 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  32.85 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.79 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  29.18 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  28.85 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.78 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.33 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.34 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  30.79 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.91 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  33.96 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  27.96 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  28.3 
 
 		 330 aa  99  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.88 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  30.33 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  31.94 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.15 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.15 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.15 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.12 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.93 
 
 		 306 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.67 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  33.23 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  30.13 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  31.82 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  33.01 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  28.75 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  33.23 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  27.52 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  27.52 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  32.09 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  29.12 
 
 		 317 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.64 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.23 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.28 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  29.18 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  32.36 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.01 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.66 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  32.27 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  31.15 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  31 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 355 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.87 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  26.93 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  29.18 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  31.01 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  25.85 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  29.36 
 
 		 333 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.21 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  31.41 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  32.9 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  30.66 
 
 		 331 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.28 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.61 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.5 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  28.31 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.07 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  34.53 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 		 330 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.5 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26.88 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  29.18 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>