More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1435 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  93.17 
 
 		 298 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  46.94 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  47.28 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  46.6 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  47.83 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  44.93 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  47.28 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  48.81 
 
 		 300 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  42.96 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  48.36 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  45.12 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  47.42 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  40.54 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  34.68 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  34.65 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  37.21 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  40.07 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  33.89 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  37.02 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  35.67 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  32.6 
 
 		 338 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  35.66 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.48 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  30.74 
 
 		 407 aa  89.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.77 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  36.7 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  29.47 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  34.2 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  24.06 
 
 		 338 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  31.94 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  34.56 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  32.44 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  23.85 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  31.98 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  37.26 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  29.26 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  37.07 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.81 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  33.21 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  29.66 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  30.14 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  26.34 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  33.97 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  35.5 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  30.52 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  31 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  34.98 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  27.8 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  31.8 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3692  PfkB domain protein  37.36 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  31.3 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  34.7 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  32.82 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  31.13 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  31.89 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  35.2 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  32.59 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.94 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  29.88 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  31.32 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  32.77 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  32.83 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  30.08 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  35.32 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.88 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.88 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.88 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.88 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  30.08 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.88 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  30.94 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.46 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  31.37 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28.86 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  34.23 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.24 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  32.46 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  32.13 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  31.05 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  36.02 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  25.68 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  30.36 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>