More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2923 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  100 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  59.67 
 
 		 306 aa  331  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  49.01 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  45.31 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  43.95 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  42.76 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  40 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  39.37 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  29.78 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  31.44 
 
 		 325 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  32.12 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  32.12 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  32.25 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  32.45 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  31.79 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  25.34 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  32.12 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  32.21 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  31.23 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  30.9 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  30.9 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  23.89 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  30.9 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  30.9 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  30.19 
 
 		 424 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  28.42 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  30.23 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.71 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.25 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 398 aa  92.4  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.9 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  25.78 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  30.57 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  29.48 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  30.57 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.75 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  25.66 
 
 		 403 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  30.25 
 
 		 308 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  31.43 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  26.33 
 
 		 308 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  28.92 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  29.17 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  31.11 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  28.19 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  30.16 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.75 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  27.95 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  29.88 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  30.91 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  25.08 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  30.28 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  27.36 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  28.26 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  28.26 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  29.75 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  28.26 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  28.53 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  25.71 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  28.17 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  27.95 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  27.95 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  27.95 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  27.95 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  28.3 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  28.3 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  31.83 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  30.99 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.4 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.05 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  28.3 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  27.64 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  29.87 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  24.5 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.86 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  23.79 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  26.79 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  27.64 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  27.27 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  30.54 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  27.8 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  30.4 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  30.7 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  26.17 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  28.8 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  24.19 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  27.56 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>