More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2287 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  100 
 
 
313 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  41.42 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  45.03 
 
 
306 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  40.13 
 
 
306 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  39.8 
 
 
308 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  42.27 
 
 
327 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  35.33 
 
 
321 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  34.33 
 
 
321 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  37.62 
 
 
303 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  36.54 
 
 
322 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  33.67 
 
 
321 aa  143  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.964628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  33.44 
 
 
321 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  33.44 
 
 
321 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  33.44 
 
 
321 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  33.33 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  33.33 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  33.77 
 
 
321 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  34.2 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  33.33 
 
 
325 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  33.44 
 
 
321 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  33.11 
 
 
316 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  33.44 
 
 
321 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  34.2 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  29.41 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  32.23 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 
295 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  29.63 
 
 
312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  24.4 
 
 
291 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  30.5 
 
 
403 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  32.49 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  32.49 
 
 
310 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  26.03 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  29.21 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  25.78 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  30.64 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  30.32 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  27.59 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  26.43 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  31.07 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  24.84 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  33.12 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  33.85 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  30.87 
 
 
314 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  30.06 
 
 
305 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  27.33 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.87 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.73 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.05 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  29.02 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  31.84 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.92 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.92 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  29.51 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.92 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.57 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  27.87 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.42 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.61 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.3 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.08 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.9 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  31.13 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.23 
 
 
398 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.42 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.74 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  26.93 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  30.49 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  30.21 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  28.76 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  31.06 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  27.71 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  30.74 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.59 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.91 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.47 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.17 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  26.57 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.23 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  29.25 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  29.3 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  23.57 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.48 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  31.13 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  29.52 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  30.23 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  27.33 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  27.33 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  29.39 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  28.71 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  22.01 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  27.33 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  28.8 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>