More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1253 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  100 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  57.49 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  58.2 
 
 		 210 aa  208  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  55.5 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  55.67 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  58.38 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  51.53 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  53.03 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  54.55 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  56.78 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  51.23 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  56 
 
 		 204 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  59.67 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  58.56 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  51.22 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  54.55 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  59.14 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  55.56 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  50.73 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  59.34 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  57.58 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  50.5 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  55.61 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  51.71 
 
 		 703 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  56.44 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  47.74 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  51.76 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  48.36 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  48.36 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 204 aa  178  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  50.51 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  48.57 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 705 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  51.5 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003001  thymidylate kinase  47.83 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.390558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02903  thymidylate kinase  46.86 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  46.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  51.04 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  46.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  46.12 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  49 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  50.86 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  47.44 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  44.44 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  45.41 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.5 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  47.29 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  47.8 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  48.53 
 
 		 707 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  48.45 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  48.04 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  47.24 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  46.57 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250893  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  46.43 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  48.4 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  48.4 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  47.94 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  50.54 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  45.63 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  49.24 
 
 		 686 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>