More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0007 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0007  exodeoxyribonuclease V, beta chain, putative  100 
 
 		 1026 aa  2085    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1981  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.69 
 
 		 1259 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.335433  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  23.67 
 
 		 1208 aa  221  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.15 
 
 		 1203 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  24.17 
 
 		 1224 aa  208  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.22 
 
 		 1200 aa  207  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  24.09 
 
 		 1212 aa  204  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  24.59 
 
 		 1208 aa  196  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.47 
 
 		 1242 aa  187  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2547  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.14 
 
 		 1198 aa  180  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.789149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2932  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.14 
 
 		 1198 aa  180  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4537  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.26 
 
 		 1224 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227788  normal  0.354601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3263  exonuclease V subunit beta  22.99 
 
 		 1181 aa  175  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.61 
 
 		 1224 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0761  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.96 
 
 		 1223 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.238035  normal  0.093599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4673  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.88 
 
 		 1224 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.81 
 
 		 1226 aa  168  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.76 
 
 		 1207 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.48 
 
 		 1230 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  22.85 
 
 		 1244 aa  164  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4085  exonuclease V subunit beta  23.06 
 
 		 1180 aa  163  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0991  exonuclease V subunit beta  22.03 
 
 		 1220 aa  163  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1043  exonuclease V subunit beta  22.03 
 
 		 1220 aa  163  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3231  exonuclease V subunit beta  22.03 
 
 		 1220 aa  163  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0871  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.71 
 
 		 1180 aa  160  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2966  exonuclease V subunit beta  22.71 
 
 		 1180 aa  160  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0895  exonuclease V subunit beta  22.71 
 
 		 1180 aa  160  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.861993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3140  exonuclease V subunit beta  22.71 
 
 		 1180 aa  160  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.25 
 
 		 1229 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2967  exonuclease V subunit beta  22.8 
 
 		 1170 aa  160  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.483472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  22.98 
 
 		 1183 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1459  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 		 1226 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0011  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.74 
 
 		 1241 aa  160  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3042  exonuclease V subunit beta  22.54 
 
 		 1180 aa  158  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.13 
 
 		 1204 aa  152  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2642  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.12 
 
 		 1229 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.14 
 
 		 1230 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3389  exonuclease V subunit beta  21.44 
 
 		 1203 aa  147  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1433  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.91 
 
 		 1199 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.84 
 
 		 1269 aa  142  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0929  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.96 
 
 		 1216 aa  141  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02668  exonuclease V (RecBCD complex), beta subunit  24.78 
 
 		 1180 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.501353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  24.97 
 
 		 1181 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02629  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1180 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  24.71 
 
 		 1181 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  24.97 
 
 		 1181 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  24.71 
 
 		 1181 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1651  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.35 
 
 		 1226 aa  140  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  24.71 
 
 		 1181 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1814  exodeoxyribonuclease V beta chain  24.3 
 
 		 1242 aa  137  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1746  UvrD/REP helicase  24.3 
 
 		 1243 aa  137  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1401  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.21 
 
 		 1221 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09621  UvrD/REP helicase subunit B  24.84 
 
 		 1274 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.22 
 
 		 1240 aa  134  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0914  exonuclease V subunit beta  25.34 
 
 		 1194 aa  132  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4014  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.87 
 
 		 1226 aa  132  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.4 
 
 		 1168 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1055  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.72 
 
 		 1203 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.7 
 
 		 1276 aa  128  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3007  exonuclease V subunit beta  21.98 
 
 		 1189 aa  126  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  26.8 
 
 		 1208 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12101  UvrD/REP helicase subunit B  28.09 
 
 		 1208 aa  124  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2025  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.29 
 
 		 1224 aa  124  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0579  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.76 
 
 		 1085 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0324  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.9 
 
 		 1129 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.904758 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.2 
 
 		 1208 aa  121  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0953517  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1359  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.68 
 
 		 1226 aa  119  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14771  UvrD/REP helicase subunit B  23.59 
 
 		 1261 aa  119  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.248766 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0645  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.96 
 
 		 1261 aa  118  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.23 
 
 		 1240 aa  118  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  27.33 
 
 		 1152 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2838  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.53 
 
 		 1230 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.506585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2148  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.05 
 
 		 1259 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1748  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.67 
 
 		 1241 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4565  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1273 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2279  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 		 1273 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.44 
 
 		 1272 aa  114  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000848552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2291  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 		 1273 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0344  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  20.94 
 
 		 1130 aa  112  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  24.66 
 
 		 1074 aa  111  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2088  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.42 
 
 		 1236 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1614  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.42 
 
 		 1232 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2047  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.06 
 
 		 1273 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.680974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4568  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.51 
 
 		 1263 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1774  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.32 
 
 		 1274 aa  109  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.38 
 
 		 1234 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0918971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1057 aa  108  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4323  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.05 
 
 		 1236 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0546  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.26 
 
 		 1183 aa  108  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1098  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.38 
 
 		 1234 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2094  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.84 
 
 		 1273 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.780628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1215  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 		 1235 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.513189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1188  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 		 1235 aa  108  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.513756  normal  0.625115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0735  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.28 
 
 		 2007 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11941  UvrD/REP helicase subunit B  28.72 
 
 		 1212 aa  107  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2246  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.95 
 
 		 1263 aa  107  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.64 
 
 		 1200 aa  107  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0997  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.82 
 
 		 1203 aa  107  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2420  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.34 
 
 		 1238 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2111  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.6 
 
 		 1251 aa  107  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>