147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 919 aa  1838    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  42.59 
 
 		 944 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  38.09 
 
 		 929 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  37.3 
 
 		 933 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  34.99 
 
 		 832 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  36.9 
 
 		 944 aa  341  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  28.76 
 
 		 887 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  34.45 
 
 		 854 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  30.7 
 
 		 927 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  27.14 
 
 		 908 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.96 
 
 		 962 aa  266  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.76 
 
 		 1540 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  31.99 
 
 		 905 aa  259  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  32.32 
 
 		 899 aa  252  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  31.4 
 
 		 965 aa  251  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  29.39 
 
 		 879 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  35.42 
 
 		 922 aa  248  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  28.54 
 
 		 860 aa  246  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  29.8 
 
 		 854 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.41 
 
 		 970 aa  243  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  29.39 
 
 		 948 aa  243  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.67 
 
 		 971 aa  242  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  33.75 
 
 		 968 aa  240  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  33.48 
 
 		 906 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.69 
 
 		 885 aa  230  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  29.89 
 
 		 921 aa  224  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  29.7 
 
 		 943 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.77 
 
 		 892 aa  218  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  30.38 
 
 		 901 aa  218  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  30.27 
 
 		 915 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  33.76 
 
 		 986 aa  215  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  31.59 
 
 		 918 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  31.37 
 
 		 897 aa  213  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  27.9 
 
 		 899 aa  212  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  29.68 
 
 		 860 aa  210  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  30.89 
 
 		 912 aa  204  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  30.88 
 
 		 912 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  28.46 
 
 		 888 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  28.74 
 
 		 888 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  29.79 
 
 		 883 aa  202  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  30.06 
 
 		 904 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  32.71 
 
 		 892 aa  201  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  28.46 
 
 		 888 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  28.34 
 
 		 907 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.76 
 
 		 897 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  36.08 
 
 		 701 aa  193  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  28.48 
 
 		 871 aa  193  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  31.41 
 
 		 897 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  29.34 
 
 		 837 aa  188  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  29.22 
 
 		 887 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.3 
 
 		 920 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  27.96 
 
 		 908 aa  185  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  29.36 
 
 		 899 aa  186  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  28.41 
 
 		 887 aa  185  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  29.4 
 
 		 885 aa  184  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  29.65 
 
 		 899 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  34.43 
 
 		 594 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  25.62 
 
 		 823 aa  172  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  32.93 
 
 		 881 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  34.59 
 
 		 456 aa  148  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  30.85 
 
 		 871 aa  145  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  30.46 
 
 		 887 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  30.82 
 
 		 876 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  29.12 
 
 		 868 aa  131  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.18 
 
 		 885 aa  128  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  29.61 
 
 		 857 aa  127  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  29.85 
 
 		 888 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.3 
 
 		 737 aa  112  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 729 aa  107  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  28.91 
 
 		 804 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  24.87 
 
 		 750 aa  104  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  23.81 
 
 		 741 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  26.91 
 
 		 762 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  30.69 
 
 		 779 aa  101  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.41 
 
 		 744 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  26.17 
 
 		 778 aa  99.4  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.03 
 
 		 775 aa  99  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  28.24 
 
 		 795 aa  95.1  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 781 aa  94.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  26.03 
 
 		 763 aa  91.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  28.68 
 
 		 783 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  29.81 
 
 		 801 aa  90.1  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  21.98 
 
 		 736 aa  89.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  18.83 
 
 		 764 aa  86.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  29.18 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  24.68 
 
 		 750 aa  84  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  23.45 
 
 		 917 aa  83.2  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.37 
 
 		 733 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  20.44 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 1027 aa  79  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  20.94 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  22.82 
 
 		 726 aa  77  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  19.63 
 
 		 651 aa  75.9  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  26.47 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  24.23 
 
 		 741 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  26.62 
 
 		 811 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.06 
 
 		 799 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  23.8 
 
 		 807 aa  70.1  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  21.91 
 
 		 822 aa  68.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  26.28 
 
 		 864 aa  67.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>