More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2090 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  47.08 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  47.94 
 
 		 1436 aa  1138    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  50.16 
 
 		 1407 aa  1223    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  46.24 
 
 		 1367 aa  1050    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  42.2 
 
 		 1468 aa  991    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  48.84 
 
 		 1527 aa  1165    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  47.08 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  51.37 
 
 		 1210 aa  874    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  47.08 
 
 		 1433 aa  1126    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  39.64 
 
 		 1493 aa  873    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  47.5 
 
 		 1402 aa  1174    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  47.08 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  49.63 
 
 		 1426 aa  1189    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  44.64 
 
 		 1390 aa  966    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  48.44 
 
 		 1444 aa  1137    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  51.85 
 
 		 1397 aa  1243    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  47.25 
 
 		 1447 aa  1110    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1421 aa  2913    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  47.9 
 
 		 1435 aa  1157    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  47.6 
 
 		 1433 aa  1205    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  47.08 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  48.36 
 
 		 1438 aa  1139    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  48.36 
 
 		 1438 aa  1139    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  40.7 
 
 		 1479 aa  900    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  51.74 
 
 		 1214 aa  920    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  43.71 
 
 		 1365 aa  1032    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  47.27 
 
 		 1433 aa  1126    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  45.7 
 
 		 1367 aa  1053    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  46.81 
 
 		 1362 aa  1028    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  50.52 
 
 		 1449 aa  1209    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  50.61 
 
 		 1449 aa  1211    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  50.24 
 
 		 1212 aa  851    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  39.02 
 
 		 1438 aa  795    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  43.37 
 
 		 1635 aa  998    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  42.7 
 
 		 1437 aa  942    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  45.24 
 
 		 1432 aa  1046    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  42.56 
 
 		 1437 aa  952    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  40.44 
 
 		 1464 aa  1019    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  43.05 
 
 		 1443 aa  1036    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  47.2 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  43.99 
 
 		 1388 aa  978    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  47.44 
 
 		 1433 aa  1140    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  36.71 
 
 		 1442 aa  757    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  52.22 
 
 		 1465 aa  1460    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  49 
 
 		 1440 aa  1185    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  46.77 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  45.37 
 
 		 1442 aa  1207    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  47 
 
 		 1433 aa  1125    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  43.22 
 
 		 970 aa  629  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  40.61 
 
 		 989 aa  597  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  52.9 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  26.4 
 
 		 1127 aa  191  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  24.62 
 
 		 1145 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  25.52 
 
 		 1156 aa  173  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  24.75 
 
 		 1155 aa  170  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  24.78 
 
 		 1170 aa  166  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  22.55 
 
 		 1139 aa  165  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1148 aa  165  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  24.97 
 
 		 1181 aa  164  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  24.48 
 
 		 1165 aa  164  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.23 
 
 		 1157 aa  162  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0035  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1228 aa  160  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.24 
 
 		 1153 aa  160  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  24.97 
 
 		 1170 aa  160  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  24.18 
 
 		 1165 aa  160  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  23.54 
 
 		 1240 aa  157  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  24.08 
 
 		 1167 aa  157  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  24.8 
 
 		 1130 aa  155  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  22.8 
 
 		 1151 aa  155  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  24.64 
 
 		 1170 aa  155  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  22.83 
 
 		 1177 aa  154  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  24.3 
 
 		 1174 aa  154  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  22.33 
 
 		 1214 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2499  DNA polymerase III, alpha subunit  24.22 
 
 		 1260 aa  152  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.29 
 
 		 1176 aa  152  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  23.97 
 
 		 1159 aa  151  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.53 
 
 		 1155 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.84 
 
 		 1122 aa  149  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  23.12 
 
 		 1162 aa  149  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  23.81 
 
 		 1155 aa  147  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  22.65 
 
 		 1075 aa  146  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  38.3 
 
 		 551 aa  146  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.57 
 
 		 595 aa  146  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22680  DNA polymerase III, alpha subunit  23.11 
 
 		 1181 aa  145  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.149072 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12030  DNA-directed DNA polymerase III PolC  23.83 
 
 		 1165 aa  145  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2376  DNA polymerase III subunit alpha  22.74 
 
 		 1178 aa  145  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51094 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  23.61 
 
 		 1189 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  23.16 
 
 		 1177 aa  144  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  23 
 
 		 1184 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.41 
 
 		 1134 aa  144  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  23.41 
 
 		 1210 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  23.41 
 
 		 1210 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  36.67 
 
 		 645 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  22.93 
 
 		 1476 aa  141  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  21.85 
 
 		 1159 aa  141  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  23.36 
 
 		 1148 aa  140  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  24.12 
 
 		 1180 aa  140  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  24.32 
 
 		 1454 aa  140  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  22.86 
 
 		 1180 aa  139  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1296  DNA polymerase III, alpha subunit  22.38 
 
 		 1181 aa  140  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>