126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6281 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
179 aa  357  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.25 
 
 
186 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  47.02 
 
 
187 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 
176 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 
176 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 
176 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.63 
 
 
220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.96 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  40.96 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  40.96 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  37.35 
 
 
176 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  37.35 
 
 
176 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  38.41 
 
 
178 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  36.13 
 
 
187 aa  99  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.42 
 
 
178 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  36.69 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.65 
 
 
194 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
200 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  35.76 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
180 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  38.51 
 
 
193 aa  91.3  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  34.23 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
229 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  35.93 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
190 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  34.9 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  34.34 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  37.42 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  32.45 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  36.92 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  33.78 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  33.56 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  30.92 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  35.1 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  35.1 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  35.1 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  36.13 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
229 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  29.41 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  36.11 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.97 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.75 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.68 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  31.03 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  32.1 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  32.64 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.54 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.63 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  30.6 
 
 
190 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 
189 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  25.61 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  36.72 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  36.72 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  36.72 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  36.72 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  36.72 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  36.72 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.72 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  26.8 
 
 
211 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  27.85 
 
 
204 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 
180 aa  54.7  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  35.29 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  34.38 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.03 
 
 
184 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  30.4 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  24.04 
 
 
207 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.58 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  32.81 
 
 
184 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  29.27 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  27.14 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  24.59 
 
 
207 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.85 
 
 
182 aa  51.2  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 
181 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  32.81 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  28.23 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.01 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  31.76 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  27.65 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 
213 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>