More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0924 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 356 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  40.27 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  33.06 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  34.95 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  37.09 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  33.12 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  31.15 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  33.23 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  31.74 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.74 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.25 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  31.74 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  31.74 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  30.56 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  31.74 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  31.74 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.46 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  31.74 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  31.07 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  30.56 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  31.07 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  30.09 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  30.56 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  29.97 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  29.64 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  29.64 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  30.52 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  28.34 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  28.34 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  28.34 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  32.71 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  29.39 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  27.42 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  30.2 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  30.66 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  27 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.2 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  30.9 
 
 		 319 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  29.6 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  30.77 
 
 		 319 aa  99.4  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  27.11 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  27.67 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  26.96 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  49.5 
 
 		 230 aa  92.8  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.46 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  28.79 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  25.86 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  30.38 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  46.73 
 
 		 226 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.27 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 264 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 261 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  41.96 
 
 		 261 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  26.29 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  41.96 
 
 		 261 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 262 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  26.51 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  31 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.59 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  31 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  31.97 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.39 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  26.12 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  46.67 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  26.12 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  47 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  27.47 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  46.74 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  43.14 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.52 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.18 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  46 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  26.78 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  27.68 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>