More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0692 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  57.67 
 
 
608 aa  723  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 
606 aa  648  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  56.13 
 
 
606 aa  724  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  55.69 
 
 
614 aa  706  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  54.19 
 
 
607 aa  667  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  54.36 
 
 
602 aa  655  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
608 aa  683  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2993  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 
608 aa  642  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0818072  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 
608 aa  659  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.44002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 
603 aa  673  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  56.42 
 
 
599 aa  686  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  51.85 
 
 
607 aa  638  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0019  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 
605 aa  642  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664015  normal  0.72367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 
609 aa  684  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  54.19 
 
 
607 aa  667  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  54.61 
 
 
607 aa  679  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  54.61 
 
 
607 aa  679  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  53.29 
 
 
612 aa  659  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02547  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 
609 aa  641  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.404241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  54.77 
 
 
606 aa  670  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 
608 aa  668  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  54.61 
 
 
607 aa  679  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  55.11 
 
 
608 aa  674  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
609 aa  637  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  55.28 
 
 
608 aa  677  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1704  GTP-binding protein TypA  51.25 
 
 
606 aa  647  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5376e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  52.07 
 
 
609 aa  635  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 
608 aa  681  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 
603 aa  678  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  52.49 
 
 
606 aa  644  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
607 aa  661  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 
607 aa  676  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  1.10369e-05 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  56.97 
 
 
600 aa  704  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  52.19 
 
 
613 aa  650  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  51.42 
 
 
614 aa  647  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.55128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 
606 aa  645  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 
615 aa  694  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  60.27 
 
 
599 aa  752  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.75691e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 
609 aa  684  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  53.6 
 
 
606 aa  663  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 
603 aa  678  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  53.94 
 
 
607 aa  657  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  53.1 
 
 
605 aa  638  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  56.25 
 
 
608 aa  687  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
607 aa  674  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  55.38 
 
 
598 aa  676  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 
615 aa  659  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.38787e-05  hitchhiker  1.36232e-06 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 
615 aa  694  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 
606 aa  687  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  54.61 
 
 
607 aa  679  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  54.61 
 
 
607 aa  679  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  56.33 
 
 
609 aa  691  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 
627 aa  655  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  54.19 
 
 
602 aa  653  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  56.47 
 
 
600 aa  697  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  56.78 
 
 
602 aa  701  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  54.19 
 
 
607 aa  667  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  58.25 
 
 
602 aa  720  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 
616 aa  658  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  56.19 
 
 
614 aa  710  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  55.46 
 
 
609 aa  674  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  55.09 
 
 
605 aa  680  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 
608 aa  683  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.14 
 
 
596 aa  679  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
607 aa  659  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 
607 aa  683  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  54.61 
 
 
607 aa  679  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  54.59 
 
 
607 aa  682  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  54.94 
 
 
606 aa  671  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  55.27 
 
 
613 aa  692  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2751  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 
611 aa  652  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  54.24 
 
 
606 aa  673  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  57.58 
 
 
602 aa  714  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 
616 aa  711  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1250  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 
609 aa  662  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0809475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 
605 aa  653  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  59.6 
 
 
605 aa  764  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  60.6 
 
 
601 aa  761  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.65728e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 
599 aa  643  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  55.8 
 
 
597 aa  683  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  50.84 
 
 
598 aa  640  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 
605 aa  655  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  75.5 
 
 
603 aa  947  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
604 aa  1221  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  55.13 
 
 
599 aa  694  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  53.03 
 
 
608 aa  668  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  55.95 
 
 
609 aa  687  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0383  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 
613 aa  643  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  53.02 
 
 
607 aa  656  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 
614 aa  697  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
608 aa  692  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
609 aa  658  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  52.02 
 
 
601 aa  641  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 
615 aa  664  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  54.78 
 
 
596 aa  676  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 
608 aa  643  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  55.03 
 
 
607 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  60.43 
 
 
601 aa  759  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 
615 aa  664  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  54.83 
 
 
610 aa  684  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>