279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2985 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  100 
 
 
618 aa  1268    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  38.88 
 
 
639 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02746  polyvinylalcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
561 aa  143  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  24.95 
 
 
577 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.15 
 
 
575 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.35 
 
 
575 aa  95.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  26.02 
 
 
718 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  26.35 
 
 
747 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  27.64 
 
 
708 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  25 
 
 
732 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 
575 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 
576 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  25.25 
 
 
573 aa  91.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0311  Pyrrolo-quinoline quinone  27.51 
 
 
705 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.394174 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 
575 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.73 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  22.9 
 
 
583 aa  87.8  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 
557 aa  87.4  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  23.16 
 
 
576 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  24.12 
 
 
573 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.12 
 
 
573 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  24.12 
 
 
573 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  25.1 
 
 
570 aa  85.5  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 
709 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2568  glucose dehydrogenase  24.47 
 
 
788 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7581  quinoprotein glucose dehydrogenase  25.55 
 
 
799 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  25.35 
 
 
562 aa  81.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 
568 aa  81.6  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
704 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  27.89 
 
 
701 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2574  quinoprotein  25.41 
 
 
791 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  29 
 
 
572 aa  80.5  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  22.8 
 
 
585 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  23.93 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1963  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  26.12 
 
 
794 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  26.63 
 
 
698 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4951  Pyrrolo-quinoline quinone  23.43 
 
 
577 aa  78.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 
528 aa  77.4  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  22.96 
 
 
738 aa  77  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 
730 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  24.29 
 
 
727 aa  74.7  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  23.61 
 
 
612 aa  74.3  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  23.05 
 
 
718 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  24.93 
 
 
726 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.14 
 
 
588 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0201  quinoprotein glucose dehydrogenase  22.35 
 
 
747 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  24.65 
 
 
720 aa  72.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  23.91 
 
 
697 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  23.61 
 
 
554 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2673  quinoprotein glucose dehydrogenase  23.44 
 
 
781 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4160  Pyrrolo-quinoline quinone  24.29 
 
 
690 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0349949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.15 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
721 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  22.29 
 
 
569 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.15 
 
 
584 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1330  quinoprotein glucose dehydrogenase  23.44 
 
 
781 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1211  quinoprotein glucose dehydrogenase  23.15 
 
 
777 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471268  normal  0.152671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  23.74 
 
 
731 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  24.53 
 
 
769 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1611  Glycerol dehydrogenase (acceptor)  24.34 
 
 
722 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0184  quinoprotein glucose dehydrogenase  21.78 
 
 
747 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.23859  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0188  quinoprotein glucose dehydrogenase  21.78 
 
 
796 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.62 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0193  quinoprotein glucose dehydrogenase  21.49 
 
 
747 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52734  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0185  quinoprotein glucose dehydrogenase  21.49 
 
 
747 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.266992  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  23.26 
 
 
597 aa  71.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  26.21 
 
 
600 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2593  quinoprotein glucose dehydrogenase  23.97 
 
 
639 aa  70.5  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238471  normal  0.0735284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1054  quinoprotein glucose dehydrogenase  25.22 
 
 
669 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  22.72 
 
 
525 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 
706 aa  70.5  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  21.47 
 
 
711 aa  70.5  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 
600 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 
718 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1594  glucose dehydrogenase  24.38 
 
 
651 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0672  quinoprotein glucose dehydrogenase  22.35 
 
 
796 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.570981  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4849  Pyrrolo-quinoline quinone  23.36 
 
 
803 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.97652  hitchhiker  0.0000763384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.62 
 
 
592 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  23.48 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  25.14 
 
 
601 aa  67.8  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  23.01 
 
 
613 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  22.32 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  22.67 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  22.92 
 
 
612 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2294  PQQ dehydrogenase family protein  25.15 
 
 
769 aa  67  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0128  glucose dehydrogenase  21.78 
 
 
796 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00123  glucose dehydrogenase  21.78 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3478  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  21.78 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2843  glucose dehydrogenase  23.75 
 
 
777 aa  66.6  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0132  quinoprotein glucose dehydrogenase  21.78 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.556262  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00122  hypothetical protein  21.78 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.793225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0134  quinoprotein glucose dehydrogenase  21.78 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0126  glucose dehydrogenase  21.78 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  25.17 
 
 
712 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3535  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  21.78 
 
 
796 aa  67  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0856  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  24.38 
 
 
779 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337612  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  24.28 
 
 
602 aa  66.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  24.83 
 
 
724 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2382  membrane-bound PQQ-dependent dehydrogenase, glucose/quinate/shikimate family  25.14 
 
 
807 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220002  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>