More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3644 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  93.48 
 
 		 460 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  93.48 
 
 		 460 aa  862    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  96.3 
 
 		 484 aa  883    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  81.09 
 
 		 460 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80.65 
 
 		 460 aa  771    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  82.17 
 
 		 460 aa  780    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  94.35 
 
 		 460 aa  869    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  79.57 
 
 		 460 aa  734    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  93.48 
 
 		 460 aa  862    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  81.96 
 
 		 460 aa  766    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  93.48 
 
 		 460 aa  862    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 		 460 aa  933    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 		 460 aa  933    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  82.17 
 
 		 460 aa  769    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  80.65 
 
 		 460 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  96.52 
 
 		 460 aa  886    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  49.45 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  47.48 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  48.36 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  47.92 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.16 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.27 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.91 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.23 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.89 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.61 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.66 
 
 		 474 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.31 
 
 		 453 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.43 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.87 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.46 
 
 		 471 aa  348  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.03 
 
 		 439 aa  349  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.83 
 
 		 455 aa  347  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  39.05 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.78 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  41.36 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.17 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.68 
 
 		 430 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.91 
 
 		 446 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.16 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.96 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.74 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  42.14 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.96 
 
 		 442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.88 
 
 		 468 aa  325  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.68 
 
 		 474 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  41.69 
 
 		 378 aa  322  7e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.05 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.71 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.84 
 
 		 466 aa  309  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.5 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.69 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.68 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.93 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.58 
 
 		 472 aa  299  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  39.9 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.27 
 
 		 480 aa  293  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.23 
 
 		 437 aa  292  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.53 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.88 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.11 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  34.15 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.92 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.07 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  36.72 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.42 
 
 		 674 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  35.66 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  35.43 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.11 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.77 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  34.49 
 
 		 471 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  34.49 
 
 		 469 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.4 
 
 		 416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.56 
 
 		 394 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.05 
 
 		 394 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.74 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.45 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.06 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.29 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.4 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.08 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  34.62 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.17 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.12 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.08 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.49 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.7 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  30.47 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  33.8 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  34.43 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.81 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.8 
 
 		 424 aa  210  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.9 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.89 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.26 
 
 		 403 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.75 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>