More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 723 aa  1484    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  49.76 
 
 		 710 aa  581  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  48.14 
 
 		 722 aa  567  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  48.14 
 
 		 750 aa  556  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  43.78 
 
 		 710 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 		 761 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.79 
 
 		 727 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.11 
 
 		 776 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 		 765 aa  342  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.75 
 
 		 824 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.81 
 
 		 648 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  37.52 
 
 		 704 aa  333  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.73 
 
 		 712 aa  332  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 755 aa  330  8e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  34.9 
 
 		 784 aa  327  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.22 
 
 		 824 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 		 811 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.04 
 
 		 806 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.24 
 
 		 643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.24 
 
 		 643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  35.53 
 
 		 640 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.36 
 
 		 734 aa  320  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.07 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.42 
 
 		 739 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  34.84 
 
 		 683 aa  317  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  35.29 
 
 		 773 aa  317  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.29 
 
 		 658 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  36.88 
 
 		 751 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  34.05 
 
 		 626 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 819 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 		 820 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.28 
 
 		 732 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.63 
 
 		 751 aa  312  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.17 
 
 		 649 aa  312  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  32.42 
 
 		 817 aa  310  8e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.05 
 
 		 625 aa  310  8e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.88 
 
 		 643 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  34.59 
 
 		 801 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  34.56 
 
 		 727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.89 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 654 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  34.11 
 
 		 681 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  35.56 
 
 		 726 aa  304  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.44 
 
 		 734 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 683 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 683 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  32.82 
 
 		 683 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  35.53 
 
 		 720 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  35.14 
 
 		 751 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 		 712 aa  301  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  35.26 
 
 		 751 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  33.8 
 
 		 676 aa  300  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  34.49 
 
 		 735 aa  300  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  33.91 
 
 		 720 aa  300  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  32.82 
 
 		 683 aa  299  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  34.63 
 
 		 680 aa  299  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  32.82 
 
 		 683 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  32.82 
 
 		 683 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  32.65 
 
 		 683 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  32.65 
 
 		 683 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  34.28 
 
 		 692 aa  296  7e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.27 
 
 		 905 aa  296  7e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 761 aa  295  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  32.99 
 
 		 683 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 		 741 aa  295  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 683 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 714 aa  294  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 833 aa  293  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  32.49 
 
 		 774 aa  293  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  34.21 
 
 		 789 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.6 
 
 		 727 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 829 aa  291  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  34.02 
 
 		 762 aa  291  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  33.53 
 
 		 719 aa  290  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 		 727 aa  290  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33.11 
 
 		 683 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  33.59 
 
 		 740 aa  288  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.91 
 
 		 714 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.85 
 
 		 859 aa  287  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  33.97 
 
 		 728 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  34.2 
 
 		 750 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  34.49 
 
 		 709 aa  286  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  31.97 
 
 		 833 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  34.86 
 
 		 757 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 		 807 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 1065 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  31.25 
 
 		 646 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  29.59 
 
 		 708 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  32.21 
 
 		 880 aa  283  8.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  32.96 
 
 		 723 aa  283  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.28 
 
 		 763 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 		 675 aa  282  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 		 779 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.21 
 
 		 667 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.46 
 
 		 776 aa  281  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  34.08 
 
 		 775 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  31.13 
 
 		 727 aa  280  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  32.66 
 
 		 714 aa  280  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>