275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03900 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  100 
 
 		 998 aa  2062    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  39.2 
 
 		 971 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  39.26 
 
 		 925 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  41.77 
 
 		 813 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  41.77 
 
 		 813 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  39.82 
 
 		 796 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  41.73 
 
 		 785 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  39.62 
 
 		 795 aa  561  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  41.56 
 
 		 815 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  40.08 
 
 		 796 aa  555  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  40.77 
 
 		 799 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  39.44 
 
 		 768 aa  542  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  39.75 
 
 		 784 aa  538  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  40.18 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  40.18 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  39.08 
 
 		 786 aa  528  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  37.48 
 
 		 778 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  39.61 
 
 		 788 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  38.82 
 
 		 794 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  28.98 
 
 		 920 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  33.63 
 
 		 455 aa  217  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  31.04 
 
 		 479 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  30.97 
 
 		 479 aa  173  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  30.82 
 
 		 479 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  28.54 
 
 		 463 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  29.85 
 
 		 485 aa  171  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.63 
 
 		 485 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.38 
 
 		 479 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  36.54 
 
 		 279 aa  146  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  24.68 
 
 		 444 aa  110  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  44.44 
 
 		 195 aa  105  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  38.73 
 
 		 154 aa  103  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.95 
 
 		 654 aa  102  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  22.09 
 
 		 473 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  26.58 
 
 		 449 aa  99.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  25.87 
 
 		 548 aa  98.2  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  26.02 
 
 		 444 aa  98.2  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  26.27 
 
 		 647 aa  96.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  25 
 
 		 443 aa  96.3  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.14 
 
 		 650 aa  96.3  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 		 451 aa  92  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 488 aa  92  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.03 
 
 		 652 aa  90.9  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  24.65 
 
 		 531 aa  87.8  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  26.48 
 
 		 558 aa  87.8  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  25 
 
 		 550 aa  87.4  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.57 
 
 		 558 aa  87  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  27.79 
 
 		 1033 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  23.53 
 
 		 982 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.73 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 440 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.25 
 
 		 499 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  25.12 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  23.94 
 
 		 558 aa  81.6  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  27.25 
 
 		 1033 aa  81.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  23.98 
 
 		 549 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  26.07 
 
 		 548 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.07 
 
 		 974 aa  80.1  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  24.34 
 
 		 581 aa  80.1  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  23.3 
 
 		 1055 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  24.46 
 
 		 1061 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  23.3 
 
 		 1055 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  23.3 
 
 		 1055 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  22.14 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 1053 aa  79  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  25.81 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  25.23 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 579 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  23.38 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 451 aa  77  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.32 
 
 		 555 aa  76.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 		 633 aa  77  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  23.82 
 
 		 1051 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 		 666 aa  76.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  24.04 
 
 		 1063 aa  76.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.6 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.6 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  26.06 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  25.77 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  23.69 
 
 		 551 aa  75.1  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  26.05 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  23.9 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  23.83 
 
 		 949 aa  74.7  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  24.32 
 
 		 564 aa  74.3  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 		 590 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  26.73 
 
 		 649 aa  74.3  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.94 
 
 		 630 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  26.6 
 
 		 451 aa  74.3  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.17 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  22.59 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  25.13 
 
 		 1058 aa  72.8  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  22.1 
 
 		 509 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  23.8 
 
 		 585 aa  72  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  23.43 
 
 		 815 aa  72  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  23.3 
 
 		 1017 aa  71.6  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  22.27 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>