More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 496 aa  987    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  58.68 
 
 		 466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  53.85 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  39.76 
 
 		 493 aa  332  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  38.58 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  40.04 
 
 		 449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  36.25 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.84 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 454 aa  249  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  34.76 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 455 aa  236  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 466 aa  223  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  31.63 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  33.83 
 
 		 460 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  32.03 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.24 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  30.75 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 451 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.57 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.16 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.62 
 
 		 496 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 449 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  29 
 
 		 447 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  31.59 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  28.48 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 451 aa  180  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.7 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 451 aa  180  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.48 
 
 		 451 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 460 aa  179  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.85 
 
 		 455 aa  179  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.98 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.51 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  30.74 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 459 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.72 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  26.71 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.27 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  26.32 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.59 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.05 
 
 		 465 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  26.06 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 		 449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 448 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.09 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 445 aa  133  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.87 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.52 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  25.52 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 440 aa  130  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  27.02 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  28.07 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  24.55 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.07 
 
 		 450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.82 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  24.31 
 
 		 454 aa  127  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  27.2 
 
 		 449 aa  127  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.1 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  24.9 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.25 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  24.81 
 
 		 546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>