More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1456 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
480 aa  958    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000857275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.28 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.71 
 
 
464 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.9 
 
 
496 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.58 
 
 
477 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2043  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.03 
 
 
477 aa  342  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.186335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.46 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.46 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.81 
 
 
486 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.83 
 
 
504 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.13 
 
 
472 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.27 
 
 
474 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.05 
 
 
461 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.81 
 
 
482 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  37.17 
 
 
486 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.61 
 
 
504 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.86 
 
 
489 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  40.57 
 
 
492 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.45 
 
 
470 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.82 
 
 
481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.62 
 
 
478 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2175  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.26 
 
 
482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388686  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.24 
 
 
475 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  37.5 
 
 
499 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1119  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.18 
 
 
473 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.83 
 
 
474 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.41 
 
 
455 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  37.66 
 
 
485 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.89 
 
 
501 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.62 
 
 
477 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.49 
 
 
480 aa  250  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.82 
 
 
485 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.51 
 
 
489 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0808  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.01 
 
 
476 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.2 
 
 
500 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  37.5 
 
 
485 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3577  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.93 
 
 
472 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000202901  normal  0.0451617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.38 
 
 
486 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0820  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.42 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127613  normal  0.415526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.42 
 
 
496 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.95 
 
 
505 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2785  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.54 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0347137  normal  0.0590439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.06 
 
 
483 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.61 
 
 
481 aa  242  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.9 
 
 
478 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.89 
 
 
514 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  33.26 
 
 
501 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.68 
 
 
482 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 
495 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  37.47 
 
 
514 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4301  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.84 
 
 
472 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.28 
 
 
511 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  35.79 
 
 
486 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.03 
 
 
486 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  35.31 
 
 
470 aa  239  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.96 
 
 
484 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.42 
 
 
514 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  33.87 
 
 
511 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6104  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.41 
 
 
468 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
476 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
476 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.43 
 
 
476 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.96 
 
 
484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.75 
 
 
484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.53 
 
 
484 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.75 
 
 
469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.75 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34 
 
 
518 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.32 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.97 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  33.55 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2257  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.55 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1069  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.54 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0125737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  35.17 
 
 
512 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4130  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.42 
 
 
468 aa  233  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  31.78 
 
 
489 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.59 
 
 
480 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3017  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.85 
 
 
469 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.757667  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  31.88 
 
 
479 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.16 
 
 
517 aa  230  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.64 
 
 
493 aa  230  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.85 
 
 
485 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.32 
 
 
473 aa  229  7e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.88 
 
 
521 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.59 
 
 
495 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.86 
 
 
489 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.62 
 
 
477 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 
507 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.04 
 
 
544 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  36.73 
 
 
508 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  36.73 
 
 
506 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  36.73 
 
 
508 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.35 
 
 
525 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  36.73 
 
 
508 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  36.73 
 
 
508 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.95 
 
 
517 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  36.73 
 
 
508 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.39 
 
 
515 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.57 
 
 
486 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1431  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.03 
 
 
479 aa  226  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>