More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1523 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  99.69 
 
 
318 aa  648  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  99.37 
 
 
318 aa  644  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  99.69 
 
 
318 aa  648  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  100 
 
 
318 aa  650  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  91.19 
 
 
317 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  90.37 
 
 
346 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  90.67 
 
 
346 aa  567  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  90.7 
 
 
346 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  78.57 
 
 
322 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  67 
 
 
313 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  66.89 
 
 
335 aa  417  1e-115  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  60.86 
 
 
308 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  61.76 
 
 
327 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  61.44 
 
 
323 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  60.66 
 
 
322 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.18 
 
 
308 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.93133e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  60.2 
 
 
308 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  59.09 
 
 
323 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 
340 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  55.26 
 
 
315 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  4.05969e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  47 
 
 
311 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  46.46 
 
 
311 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  45.85 
 
 
314 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  46.82 
 
 
317 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  45.82 
 
 
313 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  1.32087e-06  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  45.85 
 
 
326 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  45.85 
 
 
318 aa  255  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  46.56 
 
 
316 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  45.24 
 
 
323 aa  254  1e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  43.59 
 
 
322 aa  254  2e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  43.77 
 
 
325 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  45.12 
 
 
326 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  44.7 
 
 
314 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  44.22 
 
 
328 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  44.52 
 
 
321 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 
322 aa  245  7e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  43.04 
 
 
323 aa  245  7e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  43.61 
 
 
307 aa  244  1e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  43.04 
 
 
323 aa  244  1e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 
312 aa  242  6e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 
309 aa  242  8e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.26362e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  41.86 
 
 
308 aa  239  3e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
315 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  43.24 
 
 
318 aa  239  6e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  41.61 
 
 
316 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.28 
 
 
308 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  47.35 
 
 
331 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 
328 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
350 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  44.12 
 
 
316 aa  234  1e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 
314 aa  234  2e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  47.88 
 
 
304 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  40.13 
 
 
308 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  40.47 
 
 
308 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
305 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  42.76 
 
 
319 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  45.25 
 
 
331 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  40.4 
 
 
324 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  40.54 
 
 
305 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  45.18 
 
 
270 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
309 aa  225  8e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  39.6 
 
 
312 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  42.61 
 
 
319 aa  223  5e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  39.53 
 
 
307 aa  223  5e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
312 aa  222  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  39.4 
 
 
314 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  44.11 
 
 
302 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
307 aa  221  1e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  42.96 
 
 
319 aa  221  1e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  48.42 
 
 
317 aa  221  1e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  49.08 
 
 
510 aa  218  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  40.13 
 
 
307 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 
257 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  47.71 
 
 
512 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  48.23 
 
 
576 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.06 
 
 
667 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  49.77 
 
 
582 aa  216  3e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  39.93 
 
 
308 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  46.52 
 
 
904 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  45.74 
 
 
580 aa  214  1e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
583 aa  214  1e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  44.81 
 
 
589 aa  214  2e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 
315 aa  214  2e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  46.54 
 
 
576 aa  213  3e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  44.95 
 
 
580 aa  213  4e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
580 aa  213  4e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 
320 aa  213  4e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  46.12 
 
 
579 aa  212  5e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  50.23 
 
 
580 aa  213  5e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  41.33 
 
 
317 aa  213  5e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  47.96 
 
 
590 aa  212  6e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  42.81 
 
 
333 aa  212  6e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  48.86 
 
 
581 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  45.29 
 
 
580 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  48.4 
 
 
585 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  43.85 
 
 
916 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  47.96 
 
 
590 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  47.96 
 
 
578 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  47.47 
 
 
593 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  46.85 
 
 
588 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>