More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0479 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 354 aa  695    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  33.61 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  32.41 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  47.37 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  39.57 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  54.17 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  40.44 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 261 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  36.57 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  34.86 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  44 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0002  DNA polymerase III, beta chain  24.19 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  36.72 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  38.13 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  26.28 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  26.28 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.67 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 269 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  26.28 
 
 		 269 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  49.37 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  35.83 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  24.75 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  35.33 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  36.8 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  28.3 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.64 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  24.19 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  32.23 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0002  DNA polymerase III, beta chain  24.9 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  23.67 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1549  DNA polymerase III, beta subunit  24.02 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  25.2 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  35.97 
 
 		 276 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  44.16 
 
 		 258 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.27 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  40.22 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  23.08 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.46 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000025514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  33.06 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  35.21 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  22.09 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2720  DNA polymerase III, beta subunit  24.6 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  40.21 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 		 281 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  26.23 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  24.23 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>