More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0611 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  81.71 
 
 		 596 aa  968    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  62.73 
 
 		 596 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  62.54 
 
 		 596 aa  719    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  62.96 
 
 		 596 aa  740    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  81.34 
 
 		 597 aa  961    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  81.21 
 
 		 596 aa  960    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  81.04 
 
 		 596 aa  966    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  80.7 
 
 		 596 aa  961    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  62.54 
 
 		 583 aa  718    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  81.21 
 
 		 596 aa  960    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  81.21 
 
 		 596 aa  966    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  81.21 
 
 		 596 aa  960    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  100 
 
 		 593 aa  1207    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  61.18 
 
 		 596 aa  718    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  81.21 
 
 		 596 aa  960    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  55.46 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  55.77 
 
 		 589 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  51.49 
 
 		 598 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  48.81 
 
 		 589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  50.17 
 
 		 596 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  50.62 
 
 		 598 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  47.37 
 
 		 588 aa  548  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  44.37 
 
 		 589 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  49.36 
 
 		 598 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  47.9 
 
 		 597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  47.01 
 
 		 957 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  43.47 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.3 
 
 		 457 aa  355  8.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  45.96 
 
 		 925 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  45.56 
 
 		 925 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  41.72 
 
 		 608 aa  342  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  41.59 
 
 		 926 aa  336  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  39.57 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.34 
 
 		 465 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  41.51 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  40.18 
 
 		 599 aa  310  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  38.01 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  38.2 
 
 		 586 aa  280  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  37.71 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  38.04 
 
 		 584 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  37.08 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  38.68 
 
 		 609 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  38.17 
 
 		 582 aa  264  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  36.5 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  37.8 
 
 		 637 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  40.04 
 
 		 603 aa  251  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  35.81 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  35.81 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  34.99 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  34.44 
 
 		 1004 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  38.61 
 
 		 515 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 650 aa  243  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 515 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  38.83 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  37.24 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  38.3 
 
 		 616 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  34.72 
 
 		 616 aa  238  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  37.33 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.33 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  35.16 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  33.62 
 
 		 519 aa  234  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  34.33 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  33.69 
 
 		 510 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  33.86 
 
 		 1005 aa  230  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.98 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  34.13 
 
 		 483 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  35.39 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  35.39 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  34.26 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  36.3 
 
 		 631 aa  223  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  32.77 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  33.12 
 
 		 668 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  32.96 
 
 		 635 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  33.02 
 
 		 606 aa  214  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  31.82 
 
 		 627 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  31.2 
 
 		 519 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  33.61 
 
 		 561 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.78 
 
 		 577 aa  207  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  33.05 
 
 		 500 aa  203  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.03 
 
 		 499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  34.5 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 521 aa  197  7e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  31.2 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.97 
 
 		 515 aa  193  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.79 
 
 		 478 aa  193  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  31.52 
 
 		 659 aa  192  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  32.67 
 
 		 520 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  32.46 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  30.3 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  33.74 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  32.7 
 
 		 500 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  31.88 
 
 		 506 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  32.47 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.14 
 
 		 470 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  32.47 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  34.06 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  33.48 
 
 		 506 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.2 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>