More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0287 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  39.62 
 
 		 998 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  51.83 
 
 		 1429 aa  1500    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  69.46 
 
 		 1440 aa  2117    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  42.17 
 
 		 1329 aa  973    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.05 
 
 		 1124 aa  718    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  55.35 
 
 		 1432 aa  1611    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  52.44 
 
 		 1472 aa  1511    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  69.53 
 
 		 1440 aa  2117    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  55.49 
 
 		 1450 aa  1626    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.45 
 
 		 1035 aa  774    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  41.55 
 
 		 1328 aa  937    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  100 
 
 		 1441 aa  2965    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.54 
 
 		 1117 aa  692    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  39.49 
 
 		 1025 aa  621  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  37.64 
 
 		 1942 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.8 
 
 		 1176 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.59 
 
 		 891 aa  601  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.26 
 
 		 991 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.35 
 
 		 1331 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.8 
 
 		 2156 aa  588  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.91 
 
 		 946 aa  582  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  39.08 
 
 		 1062 aa  572  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  42.25 
 
 		 717 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.47 
 
 		 1975 aa  548  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.42 
 
 		 1891 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.25 
 
 		 2068 aa  516  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.21 
 
 		 1855 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.89 
 
 		 1248 aa  499  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  29.55 
 
 		 1136 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  29.56 
 
 		 852 aa  274  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  28.95 
 
 		 850 aa  271  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.8 
 
 		 1043 aa  271  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  28.8 
 
 		 852 aa  270  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  28.8 
 
 		 852 aa  270  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  28.91 
 
 		 852 aa  269  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  30.07 
 
 		 655 aa  257  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  28.57 
 
 		 874 aa  257  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  28.68 
 
 		 848 aa  256  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  27.44 
 
 		 1064 aa  252  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.95 
 
 		 655 aa  250  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  28.76 
 
 		 852 aa  250  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  27.18 
 
 		 1064 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  32.99 
 
 		 825 aa  247  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  29.16 
 
 		 856 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.07 
 
 		 842 aa  242  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  27.92 
 
 		 899 aa  242  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  28.83 
 
 		 848 aa  241  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  28.64 
 
 		 852 aa  241  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.05 
 
 		 1888 aa  240  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.76 
 
 		 2638 aa  232  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  31.38 
 
 		 647 aa  231  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  31.24 
 
 		 718 aa  230  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  29.55 
 
 		 601 aa  223  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  29.98 
 
 		 928 aa  219  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  29.04 
 
 		 713 aa  210  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  27.82 
 
 		 713 aa  211  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  29.04 
 
 		 713 aa  210  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  29.38 
 
 		 713 aa  209  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  27.67 
 
 		 713 aa  210  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  28.69 
 
 		 713 aa  208  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  29.31 
 
 		 713 aa  207  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  28.25 
 
 		 713 aa  207  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  28.35 
 
 		 713 aa  205  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  31.29 
 
 		 843 aa  201  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  26.78 
 
 		 712 aa  196  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.53 
 
 		 669 aa  197  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  30.84 
 
 		 841 aa  195  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  31.06 
 
 		 843 aa  193  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27.5 
 
 		 766 aa  191  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  26.8 
 
 		 640 aa  191  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  26.66 
 
 		 713 aa  190  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  27.15 
 
 		 1252 aa  175  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  28.71 
 
 		 640 aa  175  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  22.78 
 
 		 776 aa  151  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  27.93 
 
 		 817 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  23.31 
 
 		 701 aa  101  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  23.08 
 
 		 701 aa  95.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2272  type II secretory pathway protein  31.06 
 
 		 496 aa  94.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  23.26 
 
 		 1537 aa  95.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  23.47 
 
 		 714 aa  92  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  23.72 
 
 		 830 aa  91.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  25.52 
 
 		 701 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  23.43 
 
 		 776 aa  90.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  26.7 
 
 		 733 aa  90.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  23.71 
 
 		 695 aa  89.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  26.7 
 
 		 733 aa  89  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  23.98 
 
 		 701 aa  88.6  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  26.7 
 
 		 733 aa  89  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  26.7 
 
 		 733 aa  89  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  27.55 
 
 		 750 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  27.55 
 
 		 735 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  25.27 
 
 		 693 aa  87.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  23.72 
 
 		 721 aa  87.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  25.24 
 
 		 771 aa  87  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  22.4 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  28.1 
 
 		 752 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  28.1 
 
 		 752 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  22.82 
 
 		 701 aa  87.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  23.24 
 
 		 707 aa  86.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  22.17 
 
 		 711 aa  87  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>