More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0857 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  94.17 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  94.17 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  93.27 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3144  ABC transporter related  80.72 
 
 		 223 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  79.19 
 
 		 236 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  79.19 
 
 		 236 aa  362  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  79.82 
 
 		 236 aa  361  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  78.73 
 
 		 236 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  67.14 
 
 		 222 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  64.6 
 
 		 234 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4106  ABC transporter related  63.56 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  67.29 
 
 		 221 aa  298  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  66.51 
 
 		 222 aa  291  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 250 aa  277  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  62.32 
 
 		 244 aa  269  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001050  ABC transporter ATP-binding protein  61.98 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  50.24 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  50 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  50 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  49.54 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.39 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  48.82 
 
 		 222 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  48.1 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1578  ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  0.124176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  47.87 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  50 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  46.92 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  46.92 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2171  ABC transporter related  47.6 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  45.41 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  48.34 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2026  ABC transporter-like  49.03 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.92 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  51.28 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  42.65 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  49.29 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  42.72 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  44.72 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 250 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 250 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  48.82 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  39.52 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 256 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 256 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 256 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 345 aa  170  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.22 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  45.83 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  42.16 
 
 		 256 aa  168  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  44.08 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.5 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  40.38 
 
 		 455 aa  167  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  42.38 
 
 		 293 aa  165  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  40.48 
 
 		 258 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  38.22 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  44.39 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  41.47 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 264 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  37.16 
 
 		 604 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  44.93 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  41.01 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01332  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  42.31 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  40.48 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  45.27 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  39.63 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  40.59 
 
 		 445 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  39.81 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.83 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.29 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>